Protein–RNA interactions for Protein: P17483

HOXB4, Homeobox protein Hox-B4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 251 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB4P17483 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HOXB4P17483 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HOXB4P17483 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HOXB4P17483 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HOXB4P17483 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HOXB4P17483 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HOXB4P17483 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HOXB4P17483 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HOXB4P17483 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HOXB4P17483 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HOXB4P17483 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HOXB4P17483 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HOXB4P17483 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HOXB4P17483 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HOXB4P17483 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HOXB4P17483 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HOXB4P17483 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HOXB4P17483 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HOXB4P17483 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HOXB4P17483 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HOXB4P17483 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HOXB4P17483 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HOXB4P17483 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HOXB4P17483 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HOXB4P17483 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HOXB4P17483 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
HOXB4P17483 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HOXB4P17483 S100A6-205ENST00000496817 673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HOXB4P17483 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HOXB4P17483 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HOXB4P17483 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HOXB4P17483 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HOXB4P17483 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HOXB4P17483 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HOXB4P17483 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HOXB4P17483 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HOXB4P17483 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HOXB4P17483 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HOXB4P17483 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HOXB4P17483 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HOXB4P17483 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HOXB4P17483 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HOXB4P17483 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HOXB4P17483 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HOXB4P17483 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HOXB4P17483 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HOXB4P17483 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HOXB4P17483 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HOXB4P17483 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HOXB4P17483 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HOXB4P17483 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HOXB4P17483 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HOXB4P17483 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HOXB4P17483 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HOXB4P17483 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HOXB4P17483 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HOXB4P17483 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HOXB4P17483 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HOXB4P17483 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HOXB4P17483 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HOXB4P17483 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HOXB4P17483 AC007364.1-201ENST00000449714 1022 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HOXB4P17483 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HOXB4P17483 HLA-J-203ENST00000494367 1087 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
HOXB4P17483 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HOXB4P17483 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HOXB4P17483 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HOXB4P17483 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HOXB4P17483 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HOXB4P17483 AL022328.4-201ENST00000608025 1001 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HOXB4P17483 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HOXB4P17483 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
HOXB4P17483 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HOXB4P17483 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HOXB4P17483 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HOXB4P17483 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HOXB4P17483 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HOXB4P17483 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HOXB4P17483 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HOXB4P17483 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HOXB4P17483 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HOXB4P17483 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HOXB4P17483 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HOXB4P17483 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HOXB4P17483 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HOXB4P17483 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HOXB4P17483 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HOXB4P17483 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HOXB4P17483 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HOXB4P17483 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HOXB4P17483 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HOXB4P17483 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HOXB4P17483 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
HOXB4P17483 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HOXB4P17483 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HOXB4P17483 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HOXB4P17483 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HOXB4P17483 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HOXB4P17483 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
HOXB4P17483 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms