Protein–RNA interactions for Protein: O95398

RAPGEF3, Rap guanine nucleotide exchange factor 3, humanhuman

Predictions only

Length 923 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAPGEF3O95398 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
RAPGEF3O95398 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
RAPGEF3O95398 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.91■■■□□ 2.06
RAPGEF3O95398 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC27.91■■■□□ 2.06
RAPGEF3O95398 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC27.91■■■□□ 2.06
RAPGEF3O95398 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
RAPGEF3O95398 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
RAPGEF3O95398 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
RAPGEF3O95398 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
RAPGEF3O95398 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
RAPGEF3O95398 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
RAPGEF3O95398 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
RAPGEF3O95398 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
RAPGEF3O95398 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
RAPGEF3O95398 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
RAPGEF3O95398 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
RAPGEF3O95398 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
RAPGEF3O95398 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
RAPGEF3O95398 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
RAPGEF3O95398 METTL21AP1-201ENST00000438852 635 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
RAPGEF3O95398 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC27.9■■■□□ 2.06
RAPGEF3O95398 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
RAPGEF3O95398 RFPL4AP1-201ENST00000530883 850 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
RAPGEF3O95398 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
RAPGEF3O95398 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
RAPGEF3O95398 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
RAPGEF3O95398 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
RAPGEF3O95398 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
RAPGEF3O95398 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
RAPGEF3O95398 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
RAPGEF3O95398 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
RAPGEF3O95398 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
RAPGEF3O95398 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
RAPGEF3O95398 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
RAPGEF3O95398 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
RAPGEF3O95398 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
RAPGEF3O95398 HSD17B8-203ENST00000374662 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
RAPGEF3O95398 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
RAPGEF3O95398 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
RAPGEF3O95398 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
RAPGEF3O95398 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
RAPGEF3O95398 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
RAPGEF3O95398 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
RAPGEF3O95398 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
RAPGEF3O95398 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
RAPGEF3O95398 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
RAPGEF3O95398 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
RAPGEF3O95398 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
RAPGEF3O95398 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
RAPGEF3O95398 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
RAPGEF3O95398 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
RAPGEF3O95398 AP006288.1-201ENST00000446065 395 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
RAPGEF3O95398 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
RAPGEF3O95398 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
RAPGEF3O95398 HOPX-214ENST00000556614 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
RAPGEF3O95398 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
RAPGEF3O95398 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC27.88■■■□□ 2.05
RAPGEF3O95398 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
RAPGEF3O95398 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
RAPGEF3O95398 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
RAPGEF3O95398 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
RAPGEF3O95398 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
RAPGEF3O95398 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
RAPGEF3O95398 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
RAPGEF3O95398 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
RAPGEF3O95398 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
RAPGEF3O95398 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
RAPGEF3O95398 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
RAPGEF3O95398 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
RAPGEF3O95398 AC027243.1-201ENST00000559539 758 ntTSL 3 BASIC27.87■■■□□ 2.05
RAPGEF3O95398 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC27.87■■■□□ 2.05
RAPGEF3O95398 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC27.87■■■□□ 2.05
RAPGEF3O95398 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
RAPGEF3O95398 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
RAPGEF3O95398 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
RAPGEF3O95398 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
RAPGEF3O95398 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
RAPGEF3O95398 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
RAPGEF3O95398 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
RAPGEF3O95398 CBX2-201ENST00000269399 1061 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
RAPGEF3O95398 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
RAPGEF3O95398 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
RAPGEF3O95398 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC27.86■■■□□ 2.05
RAPGEF3O95398 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
RAPGEF3O95398 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
RAPGEF3O95398 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
RAPGEF3O95398 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
RAPGEF3O95398 AL596442.2-201ENST00000610240 980 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
RAPGEF3O95398 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
RAPGEF3O95398 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
RAPGEF3O95398 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
RAPGEF3O95398 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
RAPGEF3O95398 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
RAPGEF3O95398 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
RAPGEF3O95398 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
RAPGEF3O95398 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
RAPGEF3O95398 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
RAPGEF3O95398 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
RAPGEF3O95398 CALY-203ENST00000368558 825 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
RAPGEF3O95398 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.8 ms