Protein–RNA interactions for Protein: O15360

FANCA, Fanconi anemia group A protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,455 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FANCAO15360 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
FANCAO15360 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
FANCAO15360 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
FANCAO15360 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
FANCAO15360 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
FANCAO15360 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
FANCAO15360 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
FANCAO15360 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
FANCAO15360 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
FANCAO15360 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
FANCAO15360 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
FANCAO15360 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
FANCAO15360 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
FANCAO15360 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC28.09■■■□□ 2.09
FANCAO15360 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
FANCAO15360 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
FANCAO15360 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC28.09■■■□□ 2.09
FANCAO15360 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
FANCAO15360 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
FANCAO15360 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
FANCAO15360 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
FANCAO15360 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
FANCAO15360 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
FANCAO15360 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
FANCAO15360 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
FANCAO15360 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
FANCAO15360 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
FANCAO15360 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
FANCAO15360 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
FANCAO15360 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
FANCAO15360 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
FANCAO15360 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
FANCAO15360 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
FANCAO15360 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
FANCAO15360 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
FANCAO15360 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
FANCAO15360 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
FANCAO15360 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
FANCAO15360 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
FANCAO15360 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
FANCAO15360 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
FANCAO15360 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
FANCAO15360 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC28.08■■■□□ 2.09
FANCAO15360 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC28.08■■■□□ 2.09
FANCAO15360 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC28.08■■■□□ 2.09
FANCAO15360 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
FANCAO15360 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
FANCAO15360 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.08
FANCAO15360 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
FANCAO15360 PRRG3-205ENST00000538575 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
FANCAO15360 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
FANCAO15360 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
FANCAO15360 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
FANCAO15360 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
FANCAO15360 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
FANCAO15360 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
FANCAO15360 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC28.07■■■□□ 2.08
FANCAO15360 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
FANCAO15360 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
FANCAO15360 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
FANCAO15360 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
FANCAO15360 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
FANCAO15360 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
FANCAO15360 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
FANCAO15360 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
FANCAO15360 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
FANCAO15360 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
FANCAO15360 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC28.06■■■□□ 2.08
FANCAO15360 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
FANCAO15360 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
FANCAO15360 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
FANCAO15360 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
FANCAO15360 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
FANCAO15360 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
FANCAO15360 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
FANCAO15360 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
FANCAO15360 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
FANCAO15360 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
FANCAO15360 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.05■■■□□ 2.08
FANCAO15360 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.05■■■□□ 2.08
FANCAO15360 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC28.05■■■□□ 2.08
FANCAO15360 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
FANCAO15360 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
FANCAO15360 AC027796.2-201ENST00000575326 344 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
FANCAO15360 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.05■■■□□ 2.08
FANCAO15360 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
FANCAO15360 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
FANCAO15360 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
FANCAO15360 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
FANCAO15360 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
FANCAO15360 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
FANCAO15360 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
FANCAO15360 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
FANCAO15360 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
FANCAO15360 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
FANCAO15360 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
FANCAO15360 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
FANCAO15360 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
FANCAO15360 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC28.04■■■□□ 2.08
FANCAO15360 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms