Protein–RNA interactions for Protein: F6WH68

RTEL1-TNFRSF6B, Regulator of telomere elongation helicase 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,400 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC27.6■■■□□ 2.01
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC27.59■■■□□ 2.01
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC27.58■■■□□ 2.01
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC27.58■■■□□ 2.01
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC27.58■■■□□ 2
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC27.58■■■□□ 2
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC27.57■■■□□ 2
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC27.57■■■□□ 2
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC27.57■■■□□ 2
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC27.56■■■□□ 2
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC27.56■■■□□ 2
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC27.56■■■□□ 2
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC27.55■■■□□ 2
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC27.55■■■□□ 2
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC27.54■■■□□ 2
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC27.54■■■□□ 2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.7 ms