Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6R9

CCDC61, Coiled-coil domain-containing protein 61, humanhuman

Predictions only

Length 512 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC61Q9Y6R9 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CCDC61Q9Y6R9 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CCDC61Q9Y6R9 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CCDC61Q9Y6R9 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
CCDC61Q9Y6R9 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CCDC61Q9Y6R9 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
CCDC61Q9Y6R9 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CCDC61Q9Y6R9 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
CCDC61Q9Y6R9 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
CCDC61Q9Y6R9 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CCDC61Q9Y6R9 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CCDC61Q9Y6R9 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CCDC61Q9Y6R9 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CCDC61Q9Y6R9 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CCDC61Q9Y6R9 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CCDC61Q9Y6R9 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CCDC61Q9Y6R9 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CCDC61Q9Y6R9 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
CCDC61Q9Y6R9 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
CCDC61Q9Y6R9 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CCDC61Q9Y6R9 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CCDC61Q9Y6R9 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CCDC61Q9Y6R9 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CCDC61Q9Y6R9 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
CCDC61Q9Y6R9 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CCDC61Q9Y6R9 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CCDC61Q9Y6R9 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CCDC61Q9Y6R9 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CCDC61Q9Y6R9 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CCDC61Q9Y6R9 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CCDC61Q9Y6R9 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CCDC61Q9Y6R9 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CCDC61Q9Y6R9 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CCDC61Q9Y6R9 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CCDC61Q9Y6R9 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CCDC61Q9Y6R9 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CCDC61Q9Y6R9 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CCDC61Q9Y6R9 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CCDC61Q9Y6R9 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CCDC61Q9Y6R9 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
CCDC61Q9Y6R9 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CCDC61Q9Y6R9 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CCDC61Q9Y6R9 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CCDC61Q9Y6R9 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
CCDC61Q9Y6R9 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CCDC61Q9Y6R9 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CCDC61Q9Y6R9 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CCDC61Q9Y6R9 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CCDC61Q9Y6R9 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CCDC61Q9Y6R9 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CCDC61Q9Y6R9 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
CCDC61Q9Y6R9 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CCDC61Q9Y6R9 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CCDC61Q9Y6R9 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CCDC61Q9Y6R9 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CCDC61Q9Y6R9 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CCDC61Q9Y6R9 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CCDC61Q9Y6R9 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CCDC61Q9Y6R9 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CCDC61Q9Y6R9 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CCDC61Q9Y6R9 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CCDC61Q9Y6R9 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CCDC61Q9Y6R9 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CCDC61Q9Y6R9 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CCDC61Q9Y6R9 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CCDC61Q9Y6R9 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CCDC61Q9Y6R9 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CCDC61Q9Y6R9 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CCDC61Q9Y6R9 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
CCDC61Q9Y6R9 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CCDC61Q9Y6R9 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
CCDC61Q9Y6R9 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CCDC61Q9Y6R9 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CCDC61Q9Y6R9 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CCDC61Q9Y6R9 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CCDC61Q9Y6R9 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CCDC61Q9Y6R9 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CCDC61Q9Y6R9 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CCDC61Q9Y6R9 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CCDC61Q9Y6R9 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CCDC61Q9Y6R9 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CCDC61Q9Y6R9 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CCDC61Q9Y6R9 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CCDC61Q9Y6R9 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
CCDC61Q9Y6R9 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CCDC61Q9Y6R9 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CCDC61Q9Y6R9 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CCDC61Q9Y6R9 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CCDC61Q9Y6R9 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CCDC61Q9Y6R9 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CCDC61Q9Y6R9 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CCDC61Q9Y6R9 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CCDC61Q9Y6R9 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CCDC61Q9Y6R9 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CCDC61Q9Y6R9 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
CCDC61Q9Y6R9 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CCDC61Q9Y6R9 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CCDC61Q9Y6R9 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CCDC61Q9Y6R9 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CCDC61Q9Y6R9 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.2 ms