Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2W1

THRAP3, Thyroid hormone receptor-associated protein 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 955 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
THRAP3Q9Y2W1 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
THRAP3Q9Y2W1 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
THRAP3Q9Y2W1 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
THRAP3Q9Y2W1 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
THRAP3Q9Y2W1 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
THRAP3Q9Y2W1 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
THRAP3Q9Y2W1 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
THRAP3Q9Y2W1 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
THRAP3Q9Y2W1 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
THRAP3Q9Y2W1 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
THRAP3Q9Y2W1 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
THRAP3Q9Y2W1 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
THRAP3Q9Y2W1 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
THRAP3Q9Y2W1 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
THRAP3Q9Y2W1 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
THRAP3Q9Y2W1 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
THRAP3Q9Y2W1 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
THRAP3Q9Y2W1 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
THRAP3Q9Y2W1 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
THRAP3Q9Y2W1 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
THRAP3Q9Y2W1 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
THRAP3Q9Y2W1 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
THRAP3Q9Y2W1 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
THRAP3Q9Y2W1 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
THRAP3Q9Y2W1 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
THRAP3Q9Y2W1 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
THRAP3Q9Y2W1 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
THRAP3Q9Y2W1 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
THRAP3Q9Y2W1 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
THRAP3Q9Y2W1 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
THRAP3Q9Y2W1 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
THRAP3Q9Y2W1 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
THRAP3Q9Y2W1 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
THRAP3Q9Y2W1 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
THRAP3Q9Y2W1 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
THRAP3Q9Y2W1 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
THRAP3Q9Y2W1 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
THRAP3Q9Y2W1 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
THRAP3Q9Y2W1 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC24.34■■□□□ 1.49
THRAP3Q9Y2W1 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
THRAP3Q9Y2W1 AP001160.2-201ENST00000596071 487 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
THRAP3Q9Y2W1 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
THRAP3Q9Y2W1 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
THRAP3Q9Y2W1 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
THRAP3Q9Y2W1 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
THRAP3Q9Y2W1 PRRG3-205ENST00000538575 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
THRAP3Q9Y2W1 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
THRAP3Q9Y2W1 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
THRAP3Q9Y2W1 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
THRAP3Q9Y2W1 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
THRAP3Q9Y2W1 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
THRAP3Q9Y2W1 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
THRAP3Q9Y2W1 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
THRAP3Q9Y2W1 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
THRAP3Q9Y2W1 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
THRAP3Q9Y2W1 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
THRAP3Q9Y2W1 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC24.33■■□□□ 1.49
THRAP3Q9Y2W1 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
THRAP3Q9Y2W1 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
THRAP3Q9Y2W1 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
THRAP3Q9Y2W1 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
THRAP3Q9Y2W1 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
THRAP3Q9Y2W1 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
THRAP3Q9Y2W1 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
THRAP3Q9Y2W1 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
THRAP3Q9Y2W1 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
THRAP3Q9Y2W1 NOX4-207ENST00000525196 1555 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
THRAP3Q9Y2W1 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
THRAP3Q9Y2W1 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
THRAP3Q9Y2W1 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
THRAP3Q9Y2W1 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
THRAP3Q9Y2W1 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
THRAP3Q9Y2W1 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
THRAP3Q9Y2W1 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
THRAP3Q9Y2W1 URGCP-206ENST00000446958 365 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
THRAP3Q9Y2W1 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
THRAP3Q9Y2W1 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
THRAP3Q9Y2W1 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
THRAP3Q9Y2W1 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
THRAP3Q9Y2W1 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
THRAP3Q9Y2W1 LINC02084-201ENST00000606069 1096 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
THRAP3Q9Y2W1 CBWD2-204ENST00000433343 1411 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
THRAP3Q9Y2W1 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
THRAP3Q9Y2W1 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
THRAP3Q9Y2W1 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
THRAP3Q9Y2W1 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
THRAP3Q9Y2W1 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
THRAP3Q9Y2W1 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
THRAP3Q9Y2W1 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
THRAP3Q9Y2W1 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
THRAP3Q9Y2W1 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
THRAP3Q9Y2W1 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
THRAP3Q9Y2W1 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
THRAP3Q9Y2W1 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
THRAP3Q9Y2W1 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
THRAP3Q9Y2W1 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
THRAP3Q9Y2W1 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
THRAP3Q9Y2W1 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
THRAP3Q9Y2W1 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
THRAP3Q9Y2W1 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms