Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJ83

HACL1, 2-hydroxyacyl-CoA lyase 1, humanhuman

Predictions only

Length 578 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HACL1Q9UJ83 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
HACL1Q9UJ83 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
HACL1Q9UJ83 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
HACL1Q9UJ83 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
HACL1Q9UJ83 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
HACL1Q9UJ83 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
HACL1Q9UJ83 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
HACL1Q9UJ83 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
HACL1Q9UJ83 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
HACL1Q9UJ83 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
HACL1Q9UJ83 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
HACL1Q9UJ83 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
HACL1Q9UJ83 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
HACL1Q9UJ83 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
HACL1Q9UJ83 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
HACL1Q9UJ83 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
HACL1Q9UJ83 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
HACL1Q9UJ83 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
HACL1Q9UJ83 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
HACL1Q9UJ83 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
HACL1Q9UJ83 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
HACL1Q9UJ83 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
HACL1Q9UJ83 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
HACL1Q9UJ83 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
HACL1Q9UJ83 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
HACL1Q9UJ83 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
HACL1Q9UJ83 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
HACL1Q9UJ83 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
HACL1Q9UJ83 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
HACL1Q9UJ83 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
HACL1Q9UJ83 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
HACL1Q9UJ83 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
HACL1Q9UJ83 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
HACL1Q9UJ83 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
HACL1Q9UJ83 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
HACL1Q9UJ83 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
HACL1Q9UJ83 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
HACL1Q9UJ83 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
HACL1Q9UJ83 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
HACL1Q9UJ83 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
HACL1Q9UJ83 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
HACL1Q9UJ83 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
HACL1Q9UJ83 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
HACL1Q9UJ83 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
HACL1Q9UJ83 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
HACL1Q9UJ83 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.26■■□□□ 1.15
HACL1Q9UJ83 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
HACL1Q9UJ83 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
HACL1Q9UJ83 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
HACL1Q9UJ83 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
HACL1Q9UJ83 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC22.26■■□□□ 1.15
HACL1Q9UJ83 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
HACL1Q9UJ83 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
HACL1Q9UJ83 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
HACL1Q9UJ83 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
HACL1Q9UJ83 AL022328.4-201ENST00000608025 1001 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
HACL1Q9UJ83 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
HACL1Q9UJ83 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
HACL1Q9UJ83 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
HACL1Q9UJ83 AC079781.4-201ENST00000641908 219 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
HACL1Q9UJ83 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
HACL1Q9UJ83 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
HACL1Q9UJ83 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
HACL1Q9UJ83 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
HACL1Q9UJ83 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
HACL1Q9UJ83 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
HACL1Q9UJ83 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
HACL1Q9UJ83 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
HACL1Q9UJ83 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
HACL1Q9UJ83 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
HACL1Q9UJ83 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
HACL1Q9UJ83 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
HACL1Q9UJ83 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
HACL1Q9UJ83 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
HACL1Q9UJ83 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
HACL1Q9UJ83 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
HACL1Q9UJ83 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
HACL1Q9UJ83 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
HACL1Q9UJ83 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
HACL1Q9UJ83 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
HACL1Q9UJ83 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
HACL1Q9UJ83 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
HACL1Q9UJ83 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
HACL1Q9UJ83 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
HACL1Q9UJ83 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
HACL1Q9UJ83 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
HACL1Q9UJ83 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
HACL1Q9UJ83 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
HACL1Q9UJ83 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
HACL1Q9UJ83 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
HACL1Q9UJ83 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
HACL1Q9UJ83 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
HACL1Q9UJ83 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
HACL1Q9UJ83 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
HACL1Q9UJ83 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
HACL1Q9UJ83 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
HACL1Q9UJ83 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
HACL1Q9UJ83 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
HACL1Q9UJ83 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
HACL1Q9UJ83 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms