Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVX2

NLE1, Notchless protein homolog 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 485 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NLE1Q9NVX2 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
NLE1Q9NVX2 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
NLE1Q9NVX2 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
NLE1Q9NVX2 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
NLE1Q9NVX2 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
NLE1Q9NVX2 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
NLE1Q9NVX2 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
NLE1Q9NVX2 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
NLE1Q9NVX2 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
NLE1Q9NVX2 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
NLE1Q9NVX2 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
NLE1Q9NVX2 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
NLE1Q9NVX2 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
NLE1Q9NVX2 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
NLE1Q9NVX2 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
NLE1Q9NVX2 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
NLE1Q9NVX2 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
NLE1Q9NVX2 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
NLE1Q9NVX2 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
NLE1Q9NVX2 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
NLE1Q9NVX2 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
NLE1Q9NVX2 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
NLE1Q9NVX2 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
NLE1Q9NVX2 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
NLE1Q9NVX2 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC18.6■□□□□ 0.57
NLE1Q9NVX2 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
NLE1Q9NVX2 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
NLE1Q9NVX2 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
NLE1Q9NVX2 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
NLE1Q9NVX2 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
NLE1Q9NVX2 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
NLE1Q9NVX2 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
NLE1Q9NVX2 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
NLE1Q9NVX2 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
NLE1Q9NVX2 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
NLE1Q9NVX2 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
NLE1Q9NVX2 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
NLE1Q9NVX2 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
NLE1Q9NVX2 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
NLE1Q9NVX2 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
NLE1Q9NVX2 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
NLE1Q9NVX2 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
NLE1Q9NVX2 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
NLE1Q9NVX2 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
NLE1Q9NVX2 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
NLE1Q9NVX2 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
NLE1Q9NVX2 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
NLE1Q9NVX2 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
NLE1Q9NVX2 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
NLE1Q9NVX2 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
NLE1Q9NVX2 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
NLE1Q9NVX2 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
NLE1Q9NVX2 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
NLE1Q9NVX2 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
NLE1Q9NVX2 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
NLE1Q9NVX2 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
NLE1Q9NVX2 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
NLE1Q9NVX2 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
NLE1Q9NVX2 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
NLE1Q9NVX2 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
NLE1Q9NVX2 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
NLE1Q9NVX2 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
NLE1Q9NVX2 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
NLE1Q9NVX2 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
NLE1Q9NVX2 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
NLE1Q9NVX2 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
NLE1Q9NVX2 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
NLE1Q9NVX2 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
NLE1Q9NVX2 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
NLE1Q9NVX2 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
NLE1Q9NVX2 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
NLE1Q9NVX2 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
NLE1Q9NVX2 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
NLE1Q9NVX2 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
NLE1Q9NVX2 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
NLE1Q9NVX2 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
NLE1Q9NVX2 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
NLE1Q9NVX2 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
NLE1Q9NVX2 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
NLE1Q9NVX2 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
NLE1Q9NVX2 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
NLE1Q9NVX2 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
NLE1Q9NVX2 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
NLE1Q9NVX2 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
NLE1Q9NVX2 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
NLE1Q9NVX2 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
NLE1Q9NVX2 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
NLE1Q9NVX2 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
NLE1Q9NVX2 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
NLE1Q9NVX2 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
NLE1Q9NVX2 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
NLE1Q9NVX2 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
NLE1Q9NVX2 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
NLE1Q9NVX2 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
NLE1Q9NVX2 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
NLE1Q9NVX2 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
NLE1Q9NVX2 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
NLE1Q9NVX2 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
NLE1Q9NVX2 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
NLE1Q9NVX2 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.1 ms