Protein–RNA interactions for Protein: Q9NTX5

ECHDC1, Ethylmalonyl-CoA decarboxylase, humanhuman

Predictions only

Length 307 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECHDC1Q9NTX5 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ECHDC1Q9NTX5 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ECHDC1Q9NTX5 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ECHDC1Q9NTX5 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ECHDC1Q9NTX5 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ECHDC1Q9NTX5 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
ECHDC1Q9NTX5 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
ECHDC1Q9NTX5 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ECHDC1Q9NTX5 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ECHDC1Q9NTX5 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ECHDC1Q9NTX5 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ECHDC1Q9NTX5 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ECHDC1Q9NTX5 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ECHDC1Q9NTX5 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ECHDC1Q9NTX5 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ECHDC1Q9NTX5 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ECHDC1Q9NTX5 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ECHDC1Q9NTX5 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ECHDC1Q9NTX5 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ECHDC1Q9NTX5 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ECHDC1Q9NTX5 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ECHDC1Q9NTX5 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ECHDC1Q9NTX5 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ECHDC1Q9NTX5 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ECHDC1Q9NTX5 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ECHDC1Q9NTX5 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
ECHDC1Q9NTX5 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ECHDC1Q9NTX5 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ECHDC1Q9NTX5 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ECHDC1Q9NTX5 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ECHDC1Q9NTX5 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ECHDC1Q9NTX5 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ECHDC1Q9NTX5 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ECHDC1Q9NTX5 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
ECHDC1Q9NTX5 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
ECHDC1Q9NTX5 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
ECHDC1Q9NTX5 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ECHDC1Q9NTX5 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ECHDC1Q9NTX5 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ECHDC1Q9NTX5 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ECHDC1Q9NTX5 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ECHDC1Q9NTX5 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ECHDC1Q9NTX5 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
ECHDC1Q9NTX5 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ECHDC1Q9NTX5 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ECHDC1Q9NTX5 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ECHDC1Q9NTX5 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ECHDC1Q9NTX5 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ECHDC1Q9NTX5 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ECHDC1Q9NTX5 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ECHDC1Q9NTX5 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ECHDC1Q9NTX5 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ECHDC1Q9NTX5 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ECHDC1Q9NTX5 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ECHDC1Q9NTX5 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ECHDC1Q9NTX5 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ECHDC1Q9NTX5 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ECHDC1Q9NTX5 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ECHDC1Q9NTX5 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ECHDC1Q9NTX5 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
ECHDC1Q9NTX5 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ECHDC1Q9NTX5 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ECHDC1Q9NTX5 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ECHDC1Q9NTX5 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
ECHDC1Q9NTX5 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ECHDC1Q9NTX5 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ECHDC1Q9NTX5 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ECHDC1Q9NTX5 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ECHDC1Q9NTX5 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ECHDC1Q9NTX5 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ECHDC1Q9NTX5 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ECHDC1Q9NTX5 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ECHDC1Q9NTX5 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
ECHDC1Q9NTX5 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
ECHDC1Q9NTX5 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ECHDC1Q9NTX5 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ECHDC1Q9NTX5 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ECHDC1Q9NTX5 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
ECHDC1Q9NTX5 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ECHDC1Q9NTX5 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ECHDC1Q9NTX5 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ECHDC1Q9NTX5 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ECHDC1Q9NTX5 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ECHDC1Q9NTX5 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ECHDC1Q9NTX5 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ECHDC1Q9NTX5 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ECHDC1Q9NTX5 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ECHDC1Q9NTX5 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ECHDC1Q9NTX5 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ECHDC1Q9NTX5 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
ECHDC1Q9NTX5 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ECHDC1Q9NTX5 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ECHDC1Q9NTX5 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ECHDC1Q9NTX5 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ECHDC1Q9NTX5 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ECHDC1Q9NTX5 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ECHDC1Q9NTX5 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ECHDC1Q9NTX5 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ECHDC1Q9NTX5 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ECHDC1Q9NTX5 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms