Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY66

KDM5D, Lysine-specific demethylase 5D, humanhuman

Predictions only

Length 1,539 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM5DQ9BY66 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
KDM5DQ9BY66 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
KDM5DQ9BY66 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
KDM5DQ9BY66 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
KDM5DQ9BY66 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
KDM5DQ9BY66 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
KDM5DQ9BY66 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
KDM5DQ9BY66 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
KDM5DQ9BY66 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
KDM5DQ9BY66 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC27.54■■■□□ 2
KDM5DQ9BY66 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC27.54■■■□□ 2
KDM5DQ9BY66 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC27.54■■■□□ 2
KDM5DQ9BY66 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
KDM5DQ9BY66 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
KDM5DQ9BY66 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC27.54■■■□□ 2
KDM5DQ9BY66 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
KDM5DQ9BY66 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC27.54■■■□□ 2
KDM5DQ9BY66 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
KDM5DQ9BY66 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.54■■■□□ 2
KDM5DQ9BY66 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
KDM5DQ9BY66 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
KDM5DQ9BY66 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
KDM5DQ9BY66 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
KDM5DQ9BY66 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC27.53■■■□□ 2
KDM5DQ9BY66 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
KDM5DQ9BY66 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
KDM5DQ9BY66 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
KDM5DQ9BY66 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC27.53■■■□□ 2
KDM5DQ9BY66 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
KDM5DQ9BY66 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
KDM5DQ9BY66 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC27.53■■■□□ 2
KDM5DQ9BY66 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
KDM5DQ9BY66 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
KDM5DQ9BY66 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC27.53■■■□□ 2
KDM5DQ9BY66 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
KDM5DQ9BY66 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
KDM5DQ9BY66 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
KDM5DQ9BY66 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
KDM5DQ9BY66 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
KDM5DQ9BY66 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
KDM5DQ9BY66 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
KDM5DQ9BY66 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
KDM5DQ9BY66 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
KDM5DQ9BY66 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
KDM5DQ9BY66 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
KDM5DQ9BY66 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
KDM5DQ9BY66 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
KDM5DQ9BY66 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
KDM5DQ9BY66 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
KDM5DQ9BY66 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
KDM5DQ9BY66 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC27.52■■■□□ 2
KDM5DQ9BY66 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
KDM5DQ9BY66 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
KDM5DQ9BY66 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
KDM5DQ9BY66 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
KDM5DQ9BY66 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
KDM5DQ9BY66 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
KDM5DQ9BY66 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
KDM5DQ9BY66 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
KDM5DQ9BY66 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
KDM5DQ9BY66 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
KDM5DQ9BY66 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
KDM5DQ9BY66 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
KDM5DQ9BY66 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
KDM5DQ9BY66 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
KDM5DQ9BY66 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
KDM5DQ9BY66 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
KDM5DQ9BY66 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.51■■■□□ 2
KDM5DQ9BY66 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC27.51■■■□□ 2
KDM5DQ9BY66 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC27.51■■■□□ 2
KDM5DQ9BY66 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC27.51■■■□□ 2
KDM5DQ9BY66 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC27.51■■■□□ 2
KDM5DQ9BY66 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
KDM5DQ9BY66 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
KDM5DQ9BY66 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC27.51■■■□□ 2
KDM5DQ9BY66 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC27.51■■■□□ 2
KDM5DQ9BY66 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
KDM5DQ9BY66 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
KDM5DQ9BY66 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
KDM5DQ9BY66 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
KDM5DQ9BY66 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
KDM5DQ9BY66 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
KDM5DQ9BY66 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
KDM5DQ9BY66 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
KDM5DQ9BY66 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
KDM5DQ9BY66 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
KDM5DQ9BY66 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
KDM5DQ9BY66 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
KDM5DQ9BY66 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
KDM5DQ9BY66 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
KDM5DQ9BY66 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
KDM5DQ9BY66 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
KDM5DQ9BY66 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
KDM5DQ9BY66 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
KDM5DQ9BY66 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
KDM5DQ9BY66 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
KDM5DQ9BY66 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
KDM5DQ9BY66 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
KDM5DQ9BY66 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
KDM5DQ9BY66 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.8 ms