Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXT8

RNF17, RING finger protein 17, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,623 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF17Q9BXT8 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
RNF17Q9BXT8 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
RNF17Q9BXT8 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
RNF17Q9BXT8 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
RNF17Q9BXT8 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC27.3■■□□□ 1.96
RNF17Q9BXT8 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
RNF17Q9BXT8 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
RNF17Q9BXT8 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
RNF17Q9BXT8 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
RNF17Q9BXT8 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
RNF17Q9BXT8 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
RNF17Q9BXT8 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
RNF17Q9BXT8 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
RNF17Q9BXT8 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
RNF17Q9BXT8 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
RNF17Q9BXT8 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
RNF17Q9BXT8 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
RNF17Q9BXT8 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
RNF17Q9BXT8 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
RNF17Q9BXT8 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
RNF17Q9BXT8 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
RNF17Q9BXT8 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
RNF17Q9BXT8 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
RNF17Q9BXT8 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
RNF17Q9BXT8 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
RNF17Q9BXT8 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
RNF17Q9BXT8 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
RNF17Q9BXT8 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
RNF17Q9BXT8 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
RNF17Q9BXT8 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
RNF17Q9BXT8 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
RNF17Q9BXT8 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
RNF17Q9BXT8 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
RNF17Q9BXT8 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
RNF17Q9BXT8 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC27.29■■□□□ 1.96
RNF17Q9BXT8 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
RNF17Q9BXT8 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC27.29■■□□□ 1.96
RNF17Q9BXT8 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
RNF17Q9BXT8 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
RNF17Q9BXT8 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC27.29■■□□□ 1.96
RNF17Q9BXT8 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC27.29■■□□□ 1.96
RNF17Q9BXT8 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
RNF17Q9BXT8 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
RNF17Q9BXT8 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
RNF17Q9BXT8 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
RNF17Q9BXT8 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
RNF17Q9BXT8 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
RNF17Q9BXT8 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
RNF17Q9BXT8 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
RNF17Q9BXT8 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
RNF17Q9BXT8 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
RNF17Q9BXT8 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
RNF17Q9BXT8 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
RNF17Q9BXT8 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC27.28■■□□□ 1.96
RNF17Q9BXT8 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
RNF17Q9BXT8 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
RNF17Q9BXT8 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
RNF17Q9BXT8 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
RNF17Q9BXT8 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC27.28■■□□□ 1.96
RNF17Q9BXT8 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
RNF17Q9BXT8 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
RNF17Q9BXT8 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
RNF17Q9BXT8 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
RNF17Q9BXT8 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
RNF17Q9BXT8 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
RNF17Q9BXT8 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
RNF17Q9BXT8 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
RNF17Q9BXT8 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
RNF17Q9BXT8 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
RNF17Q9BXT8 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
RNF17Q9BXT8 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
RNF17Q9BXT8 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
RNF17Q9BXT8 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
RNF17Q9BXT8 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
RNF17Q9BXT8 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
RNF17Q9BXT8 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC27.27■■□□□ 1.96
RNF17Q9BXT8 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
RNF17Q9BXT8 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
RNF17Q9BXT8 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
RNF17Q9BXT8 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
RNF17Q9BXT8 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
RNF17Q9BXT8 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
RNF17Q9BXT8 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC27.27■■□□□ 1.96
RNF17Q9BXT8 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
RNF17Q9BXT8 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
RNF17Q9BXT8 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC27.27■■□□□ 1.96
RNF17Q9BXT8 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.96
RNF17Q9BXT8 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
RNF17Q9BXT8 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
RNF17Q9BXT8 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
RNF17Q9BXT8 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
RNF17Q9BXT8 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
RNF17Q9BXT8 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
RNF17Q9BXT8 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
RNF17Q9BXT8 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
RNF17Q9BXT8 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
RNF17Q9BXT8 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC27.26■■□□□ 1.95
RNF17Q9BXT8 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
RNF17Q9BXT8 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
RNF17Q9BXT8 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12 ms