Protein–RNA interactions for Protein: Q9BX26

SYCP2, Synaptonemal complex protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,530 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCP2Q9BX26 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
SYCP2Q9BX26 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
SYCP2Q9BX26 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
SYCP2Q9BX26 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
SYCP2Q9BX26 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
SYCP2Q9BX26 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
SYCP2Q9BX26 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
SYCP2Q9BX26 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
SYCP2Q9BX26 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
SYCP2Q9BX26 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.97■■■□□ 2.07
SYCP2Q9BX26 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC27.97■■■□□ 2.07
SYCP2Q9BX26 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
SYCP2Q9BX26 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC27.97■■■□□ 2.07
SYCP2Q9BX26 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC27.97■■■□□ 2.07
SYCP2Q9BX26 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
SYCP2Q9BX26 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC27.97■■■□□ 2.07
SYCP2Q9BX26 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
SYCP2Q9BX26 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC27.96■■■□□ 2.07
SYCP2Q9BX26 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
SYCP2Q9BX26 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
SYCP2Q9BX26 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
SYCP2Q9BX26 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
SYCP2Q9BX26 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
SYCP2Q9BX26 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
SYCP2Q9BX26 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
SYCP2Q9BX26 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
SYCP2Q9BX26 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
SYCP2Q9BX26 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
SYCP2Q9BX26 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
SYCP2Q9BX26 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
SYCP2Q9BX26 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
SYCP2Q9BX26 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC27.95■■■□□ 2.06
SYCP2Q9BX26 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
SYCP2Q9BX26 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
SYCP2Q9BX26 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
SYCP2Q9BX26 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
SYCP2Q9BX26 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
SYCP2Q9BX26 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
SYCP2Q9BX26 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
SYCP2Q9BX26 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
SYCP2Q9BX26 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC27.95■■■□□ 2.06
SYCP2Q9BX26 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC27.94■■■□□ 2.06
SYCP2Q9BX26 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
SYCP2Q9BX26 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
SYCP2Q9BX26 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
SYCP2Q9BX26 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC27.94■■■□□ 2.06
SYCP2Q9BX26 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
SYCP2Q9BX26 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
SYCP2Q9BX26 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
SYCP2Q9BX26 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
SYCP2Q9BX26 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
SYCP2Q9BX26 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
SYCP2Q9BX26 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
SYCP2Q9BX26 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
SYCP2Q9BX26 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
SYCP2Q9BX26 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
SYCP2Q9BX26 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
SYCP2Q9BX26 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
SYCP2Q9BX26 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
SYCP2Q9BX26 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.94■■■□□ 2.06
SYCP2Q9BX26 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
SYCP2Q9BX26 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC27.93■■■□□ 2.06
SYCP2Q9BX26 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC27.93■■■□□ 2.06
SYCP2Q9BX26 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.93■■■□□ 2.06
SYCP2Q9BX26 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
SYCP2Q9BX26 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC27.93■■■□□ 2.06
SYCP2Q9BX26 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC27.93■■■□□ 2.06
SYCP2Q9BX26 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC27.93■■■□□ 2.06
SYCP2Q9BX26 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
SYCP2Q9BX26 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
SYCP2Q9BX26 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
SYCP2Q9BX26 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
SYCP2Q9BX26 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
SYCP2Q9BX26 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
SYCP2Q9BX26 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
SYCP2Q9BX26 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
SYCP2Q9BX26 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
SYCP2Q9BX26 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC27.92■■■□□ 2.06
SYCP2Q9BX26 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
SYCP2Q9BX26 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
SYCP2Q9BX26 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
SYCP2Q9BX26 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
SYCP2Q9BX26 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
SYCP2Q9BX26 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
SYCP2Q9BX26 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
SYCP2Q9BX26 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
SYCP2Q9BX26 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
SYCP2Q9BX26 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
SYCP2Q9BX26 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
SYCP2Q9BX26 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
SYCP2Q9BX26 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
SYCP2Q9BX26 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
SYCP2Q9BX26 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
SYCP2Q9BX26 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
SYCP2Q9BX26 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
SYCP2Q9BX26 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
SYCP2Q9BX26 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
SYCP2Q9BX26 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
SYCP2Q9BX26 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
SYCP2Q9BX26 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms