Protein–RNA interactions for Protein: Q9BWE0

REPIN1, Replication initiator 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 567 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
REPIN1Q9BWE0 Metazoa_SRP.91-201ENST00000622745 281 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
REPIN1Q9BWE0 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
REPIN1Q9BWE0 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
REPIN1Q9BWE0 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
REPIN1Q9BWE0 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
REPIN1Q9BWE0 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
REPIN1Q9BWE0 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
REPIN1Q9BWE0 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
REPIN1Q9BWE0 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
REPIN1Q9BWE0 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
REPIN1Q9BWE0 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
REPIN1Q9BWE0 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
REPIN1Q9BWE0 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
REPIN1Q9BWE0 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
REPIN1Q9BWE0 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
REPIN1Q9BWE0 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
REPIN1Q9BWE0 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
REPIN1Q9BWE0 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
REPIN1Q9BWE0 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
REPIN1Q9BWE0 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
REPIN1Q9BWE0 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
REPIN1Q9BWE0 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
REPIN1Q9BWE0 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
REPIN1Q9BWE0 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
REPIN1Q9BWE0 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
REPIN1Q9BWE0 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
REPIN1Q9BWE0 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC16.24■□□□□ 0.19
REPIN1Q9BWE0 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
REPIN1Q9BWE0 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
REPIN1Q9BWE0 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.24■□□□□ 0.19
REPIN1Q9BWE0 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
REPIN1Q9BWE0 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
REPIN1Q9BWE0 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
REPIN1Q9BWE0 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
REPIN1Q9BWE0 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
REPIN1Q9BWE0 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
REPIN1Q9BWE0 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
REPIN1Q9BWE0 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
REPIN1Q9BWE0 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
REPIN1Q9BWE0 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
REPIN1Q9BWE0 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
REPIN1Q9BWE0 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
REPIN1Q9BWE0 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
REPIN1Q9BWE0 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
REPIN1Q9BWE0 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
REPIN1Q9BWE0 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
REPIN1Q9BWE0 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
REPIN1Q9BWE0 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
REPIN1Q9BWE0 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
REPIN1Q9BWE0 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
REPIN1Q9BWE0 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
REPIN1Q9BWE0 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
REPIN1Q9BWE0 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
REPIN1Q9BWE0 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
REPIN1Q9BWE0 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
REPIN1Q9BWE0 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
REPIN1Q9BWE0 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
REPIN1Q9BWE0 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
REPIN1Q9BWE0 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC16.23■□□□□ 0.19
REPIN1Q9BWE0 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
REPIN1Q9BWE0 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
REPIN1Q9BWE0 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
REPIN1Q9BWE0 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
REPIN1Q9BWE0 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
REPIN1Q9BWE0 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
REPIN1Q9BWE0 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
REPIN1Q9BWE0 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
REPIN1Q9BWE0 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
REPIN1Q9BWE0 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
REPIN1Q9BWE0 AC007216.2-201ENST00000562802 384 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
REPIN1Q9BWE0 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
REPIN1Q9BWE0 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
REPIN1Q9BWE0 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
REPIN1Q9BWE0 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
REPIN1Q9BWE0 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
REPIN1Q9BWE0 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
REPIN1Q9BWE0 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
REPIN1Q9BWE0 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
REPIN1Q9BWE0 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
REPIN1Q9BWE0 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
REPIN1Q9BWE0 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
REPIN1Q9BWE0 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
REPIN1Q9BWE0 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
REPIN1Q9BWE0 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
REPIN1Q9BWE0 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
REPIN1Q9BWE0 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
REPIN1Q9BWE0 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
REPIN1Q9BWE0 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
REPIN1Q9BWE0 SULT1A1-211ENST00000569554 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
REPIN1Q9BWE0 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
REPIN1Q9BWE0 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
REPIN1Q9BWE0 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
REPIN1Q9BWE0 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
REPIN1Q9BWE0 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
REPIN1Q9BWE0 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
REPIN1Q9BWE0 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
REPIN1Q9BWE0 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
REPIN1Q9BWE0 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
REPIN1Q9BWE0 HMGB3P14-201ENST00000494195 599 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
REPIN1Q9BWE0 PDC-202ENST00000497198 1174 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.7 ms