Protein–RNA interactions for Protein: Q99666

RGPD5, RANBP2-like and GRIP domain-containing protein 5/6, humanhuman

Predictions only

Length 1,765 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RGPD5Q99666 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
RGPD5Q99666 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
RGPD5Q99666 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
RGPD5Q99666 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
RGPD5Q99666 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
RGPD5Q99666 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
RGPD5Q99666 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
RGPD5Q99666 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC24.64■■□□□ 1.54
RGPD5Q99666 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
RGPD5Q99666 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.53
RGPD5Q99666 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
RGPD5Q99666 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC24.64■■□□□ 1.53
RGPD5Q99666 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.53
RGPD5Q99666 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
RGPD5Q99666 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
RGPD5Q99666 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
RGPD5Q99666 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
RGPD5Q99666 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
RGPD5Q99666 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
RGPD5Q99666 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
RGPD5Q99666 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
RGPD5Q99666 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
RGPD5Q99666 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
RGPD5Q99666 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
RGPD5Q99666 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
RGPD5Q99666 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
RGPD5Q99666 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
RGPD5Q99666 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
RGPD5Q99666 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
RGPD5Q99666 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
RGPD5Q99666 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
RGPD5Q99666 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
RGPD5Q99666 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
RGPD5Q99666 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
RGPD5Q99666 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
RGPD5Q99666 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
RGPD5Q99666 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
RGPD5Q99666 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
RGPD5Q99666 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC24.62■■□□□ 1.53
RGPD5Q99666 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
RGPD5Q99666 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
RGPD5Q99666 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
RGPD5Q99666 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
RGPD5Q99666 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
RGPD5Q99666 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
RGPD5Q99666 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
RGPD5Q99666 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
RGPD5Q99666 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
RGPD5Q99666 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
RGPD5Q99666 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
RGPD5Q99666 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
RGPD5Q99666 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
RGPD5Q99666 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
RGPD5Q99666 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
RGPD5Q99666 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
RGPD5Q99666 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
RGPD5Q99666 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
RGPD5Q99666 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
RGPD5Q99666 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
RGPD5Q99666 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
RGPD5Q99666 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
RGPD5Q99666 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
RGPD5Q99666 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
RGPD5Q99666 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
RGPD5Q99666 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
RGPD5Q99666 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
RGPD5Q99666 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
RGPD5Q99666 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
RGPD5Q99666 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
RGPD5Q99666 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
RGPD5Q99666 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
RGPD5Q99666 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
RGPD5Q99666 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
RGPD5Q99666 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
RGPD5Q99666 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
RGPD5Q99666 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
RGPD5Q99666 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
RGPD5Q99666 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
RGPD5Q99666 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
RGPD5Q99666 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
RGPD5Q99666 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
RGPD5Q99666 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
RGPD5Q99666 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
RGPD5Q99666 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
RGPD5Q99666 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
RGPD5Q99666 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
RGPD5Q99666 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
RGPD5Q99666 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
RGPD5Q99666 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
RGPD5Q99666 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
RGPD5Q99666 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
RGPD5Q99666 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
RGPD5Q99666 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
RGPD5Q99666 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
RGPD5Q99666 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
RGPD5Q99666 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
RGPD5Q99666 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
RGPD5Q99666 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
RGPD5Q99666 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
RGPD5Q99666 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.1 ms