Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXI2

CNKSR2, Connector enhancer of kinase suppressor of ras 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,034 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNKSR2Q8WXI2 ERVH-1-201ENST00000507666 639 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CNKSR2Q8WXI2 AC080011.1-201ENST00000552378 989 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CNKSR2Q8WXI2 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CNKSR2Q8WXI2 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CNKSR2Q8WXI2 AC020978.9-201ENST00000624380 1141 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
CNKSR2Q8WXI2 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CNKSR2Q8WXI2 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CNKSR2Q8WXI2 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
CNKSR2Q8WXI2 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CNKSR2Q8WXI2 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CNKSR2Q8WXI2 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CNKSR2Q8WXI2 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CNKSR2Q8WXI2 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CNKSR2Q8WXI2 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CNKSR2Q8WXI2 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CNKSR2Q8WXI2 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CNKSR2Q8WXI2 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CNKSR2Q8WXI2 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CNKSR2Q8WXI2 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CNKSR2Q8WXI2 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CNKSR2Q8WXI2 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CNKSR2Q8WXI2 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CNKSR2Q8WXI2 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CNKSR2Q8WXI2 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CNKSR2Q8WXI2 AL353626.3-201ENST00000413399 657 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
CNKSR2Q8WXI2 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CNKSR2Q8WXI2 AC097487.1-201ENST00000514134 934 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CNKSR2Q8WXI2 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CNKSR2Q8WXI2 LINC02156-201ENST00000552320 483 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CNKSR2Q8WXI2 ACYP1-204ENST00000555135 639 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CNKSR2Q8WXI2 AC026462.4-201ENST00000565229 951 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CNKSR2Q8WXI2 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CNKSR2Q8WXI2 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CNKSR2Q8WXI2 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CNKSR2Q8WXI2 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CNKSR2Q8WXI2 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CNKSR2Q8WXI2 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CNKSR2Q8WXI2 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CNKSR2Q8WXI2 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CNKSR2Q8WXI2 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CNKSR2Q8WXI2 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CNKSR2Q8WXI2 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
CNKSR2Q8WXI2 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CNKSR2Q8WXI2 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CNKSR2Q8WXI2 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
CNKSR2Q8WXI2 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CNKSR2Q8WXI2 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CNKSR2Q8WXI2 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CNKSR2Q8WXI2 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CNKSR2Q8WXI2 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CNKSR2Q8WXI2 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CNKSR2Q8WXI2 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CNKSR2Q8WXI2 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CNKSR2Q8WXI2 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CNKSR2Q8WXI2 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CNKSR2Q8WXI2 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CNKSR2Q8WXI2 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CNKSR2Q8WXI2 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CNKSR2Q8WXI2 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CNKSR2Q8WXI2 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
CNKSR2Q8WXI2 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CNKSR2Q8WXI2 PRELID3BP7-201ENST00000503606 469 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
CNKSR2Q8WXI2 OR8K4P-201ENST00000534608 872 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
CNKSR2Q8WXI2 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CNKSR2Q8WXI2 AC130324.2-201ENST00000580873 638 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CNKSR2Q8WXI2 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CNKSR2Q8WXI2 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CNKSR2Q8WXI2 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CNKSR2Q8WXI2 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CNKSR2Q8WXI2 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CNKSR2Q8WXI2 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CNKSR2Q8WXI2 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CNKSR2Q8WXI2 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CNKSR2Q8WXI2 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CNKSR2Q8WXI2 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
CNKSR2Q8WXI2 RNF148-201ENST00000434824 1304 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CNKSR2Q8WXI2 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CNKSR2Q8WXI2 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CNKSR2Q8WXI2 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CNKSR2Q8WXI2 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CNKSR2Q8WXI2 C3orf49-201ENST00000295896 1292 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CNKSR2Q8WXI2 RNU6-673P-201ENST00000365084 104 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
CNKSR2Q8WXI2 PNRC1-203ENST00000369472 816 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CNKSR2Q8WXI2 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CNKSR2Q8WXI2 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CNKSR2Q8WXI2 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
CNKSR2Q8WXI2 AC093763.1-201ENST00000512464 699 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CNKSR2Q8WXI2 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CNKSR2Q8WXI2 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CNKSR2Q8WXI2 AC051619.5-201ENST00000559003 736 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CNKSR2Q8WXI2 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CNKSR2Q8WXI2 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CNKSR2Q8WXI2 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CNKSR2Q8WXI2 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CNKSR2Q8WXI2 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CNKSR2Q8WXI2 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CNKSR2Q8WXI2 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CNKSR2Q8WXI2 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CNKSR2Q8WXI2 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CNKSR2Q8WXI2 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms