Protein–RNA interactions for Protein: Q8WWI1

LMO7, LIM domain only protein 7, humanhuman

Predictions only

Length 1,683 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO7Q8WWI1 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
LMO7Q8WWI1 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
LMO7Q8WWI1 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
LMO7Q8WWI1 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
LMO7Q8WWI1 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
LMO7Q8WWI1 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
LMO7Q8WWI1 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
LMO7Q8WWI1 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
LMO7Q8WWI1 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
LMO7Q8WWI1 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
LMO7Q8WWI1 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
LMO7Q8WWI1 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
LMO7Q8WWI1 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
LMO7Q8WWI1 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
LMO7Q8WWI1 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
LMO7Q8WWI1 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
LMO7Q8WWI1 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
LMO7Q8WWI1 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
LMO7Q8WWI1 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
LMO7Q8WWI1 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
LMO7Q8WWI1 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
LMO7Q8WWI1 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
LMO7Q8WWI1 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
LMO7Q8WWI1 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
LMO7Q8WWI1 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
LMO7Q8WWI1 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
LMO7Q8WWI1 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
LMO7Q8WWI1 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
LMO7Q8WWI1 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
LMO7Q8WWI1 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
LMO7Q8WWI1 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
LMO7Q8WWI1 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
LMO7Q8WWI1 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
LMO7Q8WWI1 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
LMO7Q8WWI1 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
LMO7Q8WWI1 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
LMO7Q8WWI1 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
LMO7Q8WWI1 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
LMO7Q8WWI1 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
LMO7Q8WWI1 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
LMO7Q8WWI1 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
LMO7Q8WWI1 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC24.75■■□□□ 1.55
LMO7Q8WWI1 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
LMO7Q8WWI1 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
LMO7Q8WWI1 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
LMO7Q8WWI1 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
LMO7Q8WWI1 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
LMO7Q8WWI1 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
LMO7Q8WWI1 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
LMO7Q8WWI1 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
LMO7Q8WWI1 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
LMO7Q8WWI1 AC010735.2-201ENST00000607970 584 ntTSL 4 BASIC24.74■■□□□ 1.55
LMO7Q8WWI1 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
LMO7Q8WWI1 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
LMO7Q8WWI1 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
LMO7Q8WWI1 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
LMO7Q8WWI1 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
LMO7Q8WWI1 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
LMO7Q8WWI1 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
LMO7Q8WWI1 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
LMO7Q8WWI1 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
LMO7Q8WWI1 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC24.73■■□□□ 1.55
LMO7Q8WWI1 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
LMO7Q8WWI1 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
LMO7Q8WWI1 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC24.73■■□□□ 1.55
LMO7Q8WWI1 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
LMO7Q8WWI1 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
LMO7Q8WWI1 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
LMO7Q8WWI1 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
LMO7Q8WWI1 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
LMO7Q8WWI1 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
LMO7Q8WWI1 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
LMO7Q8WWI1 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
LMO7Q8WWI1 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
LMO7Q8WWI1 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
LMO7Q8WWI1 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
LMO7Q8WWI1 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
LMO7Q8WWI1 AC092183.1-201ENST00000469884 875 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
LMO7Q8WWI1 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
LMO7Q8WWI1 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
LMO7Q8WWI1 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
LMO7Q8WWI1 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC24.72■■□□□ 1.55
LMO7Q8WWI1 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC24.72■■□□□ 1.55
LMO7Q8WWI1 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
LMO7Q8WWI1 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
LMO7Q8WWI1 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
LMO7Q8WWI1 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
LMO7Q8WWI1 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
LMO7Q8WWI1 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
LMO7Q8WWI1 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
LMO7Q8WWI1 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
LMO7Q8WWI1 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
LMO7Q8WWI1 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
LMO7Q8WWI1 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
LMO7Q8WWI1 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
LMO7Q8WWI1 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
LMO7Q8WWI1 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
LMO7Q8WWI1 AC008481.3-201ENST00000585656 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
LMO7Q8WWI1 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
LMO7Q8WWI1 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
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