Protein–RNA interactions for Protein: Q8N205

SYNE4, Nesprin-4, humanhuman

Predictions only

Length 404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNE4Q8N205 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SYNE4Q8N205 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SYNE4Q8N205 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SYNE4Q8N205 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SYNE4Q8N205 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SYNE4Q8N205 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SYNE4Q8N205 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SYNE4Q8N205 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SYNE4Q8N205 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SYNE4Q8N205 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SYNE4Q8N205 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SYNE4Q8N205 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SYNE4Q8N205 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SYNE4Q8N205 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SYNE4Q8N205 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SYNE4Q8N205 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SYNE4Q8N205 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SYNE4Q8N205 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SYNE4Q8N205 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SYNE4Q8N205 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
SYNE4Q8N205 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SYNE4Q8N205 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SYNE4Q8N205 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SYNE4Q8N205 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SYNE4Q8N205 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SYNE4Q8N205 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SYNE4Q8N205 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SYNE4Q8N205 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SYNE4Q8N205 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SYNE4Q8N205 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SYNE4Q8N205 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SYNE4Q8N205 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SYNE4Q8N205 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SYNE4Q8N205 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
SYNE4Q8N205 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SYNE4Q8N205 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SYNE4Q8N205 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SYNE4Q8N205 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
SYNE4Q8N205 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SYNE4Q8N205 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SYNE4Q8N205 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
SYNE4Q8N205 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SYNE4Q8N205 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SYNE4Q8N205 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SYNE4Q8N205 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SYNE4Q8N205 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
SYNE4Q8N205 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SYNE4Q8N205 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SYNE4Q8N205 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SYNE4Q8N205 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SYNE4Q8N205 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
SYNE4Q8N205 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SYNE4Q8N205 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SYNE4Q8N205 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SYNE4Q8N205 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SYNE4Q8N205 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SYNE4Q8N205 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SYNE4Q8N205 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SYNE4Q8N205 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SYNE4Q8N205 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SYNE4Q8N205 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
SYNE4Q8N205 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
SYNE4Q8N205 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SYNE4Q8N205 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SYNE4Q8N205 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SYNE4Q8N205 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
SYNE4Q8N205 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SYNE4Q8N205 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SYNE4Q8N205 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SYNE4Q8N205 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SYNE4Q8N205 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SYNE4Q8N205 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SYNE4Q8N205 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SYNE4Q8N205 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SYNE4Q8N205 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SYNE4Q8N205 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SYNE4Q8N205 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SYNE4Q8N205 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SYNE4Q8N205 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SYNE4Q8N205 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SYNE4Q8N205 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SYNE4Q8N205 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SYNE4Q8N205 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SYNE4Q8N205 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SYNE4Q8N205 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SYNE4Q8N205 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SYNE4Q8N205 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SYNE4Q8N205 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
SYNE4Q8N205 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
SYNE4Q8N205 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
SYNE4Q8N205 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SYNE4Q8N205 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SYNE4Q8N205 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
SYNE4Q8N205 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SYNE4Q8N205 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
SYNE4Q8N205 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SYNE4Q8N205 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SYNE4Q8N205 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SYNE4Q8N205 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SYNE4Q8N205 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms