Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTU9

STRC, Stereocilin, humanhuman

Predictions only

Length 1,775 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STRCQ7RTU9 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
STRCQ7RTU9 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
STRCQ7RTU9 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
STRCQ7RTU9 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
STRCQ7RTU9 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
STRCQ7RTU9 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
STRCQ7RTU9 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
STRCQ7RTU9 ARHGAP11B-201ENST00000428041 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
STRCQ7RTU9 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
STRCQ7RTU9 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC26.36■■□□□ 1.81
STRCQ7RTU9 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
STRCQ7RTU9 AC055854.1-201ENST00000523627 570 ntTSL 4 BASIC26.36■■□□□ 1.81
STRCQ7RTU9 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
STRCQ7RTU9 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
STRCQ7RTU9 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
STRCQ7RTU9 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
STRCQ7RTU9 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
STRCQ7RTU9 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
STRCQ7RTU9 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
STRCQ7RTU9 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
STRCQ7RTU9 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
STRCQ7RTU9 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
STRCQ7RTU9 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
STRCQ7RTU9 BAD-202ENST00000394531 631 ntTSL 3 BASIC26.35■■□□□ 1.81
STRCQ7RTU9 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
STRCQ7RTU9 LINC02558-202ENST00000436395 298 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
STRCQ7RTU9 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
STRCQ7RTU9 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
STRCQ7RTU9 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
STRCQ7RTU9 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
STRCQ7RTU9 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC26.35■■□□□ 1.81
STRCQ7RTU9 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
STRCQ7RTU9 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
STRCQ7RTU9 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
STRCQ7RTU9 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
STRCQ7RTU9 METTL26-204ENST00000397665 558 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
STRCQ7RTU9 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC26.35■■□□□ 1.81
STRCQ7RTU9 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
STRCQ7RTU9 Z92544.3-201ENST00000624747 417 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
STRCQ7RTU9 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
STRCQ7RTU9 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
STRCQ7RTU9 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
STRCQ7RTU9 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
STRCQ7RTU9 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
STRCQ7RTU9 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
STRCQ7RTU9 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
STRCQ7RTU9 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
STRCQ7RTU9 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
STRCQ7RTU9 MEIS3P1-201ENST00000495167 958 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
STRCQ7RTU9 WDR25-203ENST00000542471 1214 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
STRCQ7RTU9 ICAM2-205ENST00000578379 1064 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
STRCQ7RTU9 ICAM2-206ENST00000578892 1056 ntTSL 3 BASIC26.34■■□□□ 1.81
STRCQ7RTU9 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
STRCQ7RTU9 MRPL16-201ENST00000300151 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
STRCQ7RTU9 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
STRCQ7RTU9 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
STRCQ7RTU9 AP006333.1-201ENST00000543817 575 ntTSL 4 BASIC26.33■■□□□ 1.81
STRCQ7RTU9 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC26.33■■□□□ 1.81
STRCQ7RTU9 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
STRCQ7RTU9 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
STRCQ7RTU9 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
STRCQ7RTU9 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
STRCQ7RTU9 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
STRCQ7RTU9 WDR61-201ENST00000267973 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
STRCQ7RTU9 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
STRCQ7RTU9 AC092474.2-201ENST00000424288 719 ntBASIC26.33■■□□□ 1.8
STRCQ7RTU9 RNF34-208ENST00000555076 593 ntTSL 3 BASIC26.33■■□□□ 1.8
STRCQ7RTU9 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC26.33■■□□□ 1.8
STRCQ7RTU9 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
STRCQ7RTU9 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
STRCQ7RTU9 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
STRCQ7RTU9 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
STRCQ7RTU9 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
STRCQ7RTU9 DHRS7-212ENST00000611054 1321 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
STRCQ7RTU9 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC26.32■■□□□ 1.8
STRCQ7RTU9 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
STRCQ7RTU9 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
STRCQ7RTU9 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
STRCQ7RTU9 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
STRCQ7RTU9 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
STRCQ7RTU9 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
STRCQ7RTU9 RWDD3-201ENST00000263893 1078 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
STRCQ7RTU9 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
STRCQ7RTU9 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
STRCQ7RTU9 AC190387.1-201ENST00000551683 408 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
STRCQ7RTU9 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
STRCQ7RTU9 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC26.32■■□□□ 1.8
STRCQ7RTU9 CBR3-AS1-216ENST00000624883 564 ntTSL 3 BASIC26.32■■□□□ 1.8
STRCQ7RTU9 AL359644.1-202ENST00000637541 571 ntTSL 3 BASIC26.32■■□□□ 1.8
STRCQ7RTU9 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
STRCQ7RTU9 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
STRCQ7RTU9 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
STRCQ7RTU9 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
STRCQ7RTU9 LST1-202ENST00000303757 604 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
STRCQ7RTU9 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
STRCQ7RTU9 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
STRCQ7RTU9 AC012645.4-201ENST00000610691 1061 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
STRCQ7RTU9 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
STRCQ7RTU9 GOLGA6L17P-202ENST00000614358 1398 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
STRCQ7RTU9 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.2 ms