Protein–RNA interactions for Protein: Q71RC9

SMIM5, Small integral membrane protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 77 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM5Q71RC9 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SMIM5Q71RC9 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SMIM5Q71RC9 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SMIM5Q71RC9 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SMIM5Q71RC9 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SMIM5Q71RC9 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
SMIM5Q71RC9 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SMIM5Q71RC9 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SMIM5Q71RC9 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SMIM5Q71RC9 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SMIM5Q71RC9 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
SMIM5Q71RC9 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SMIM5Q71RC9 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SMIM5Q71RC9 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SMIM5Q71RC9 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SMIM5Q71RC9 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SMIM5Q71RC9 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SMIM5Q71RC9 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SMIM5Q71RC9 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
SMIM5Q71RC9 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
SMIM5Q71RC9 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SMIM5Q71RC9 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SMIM5Q71RC9 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SMIM5Q71RC9 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SMIM5Q71RC9 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
SMIM5Q71RC9 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SMIM5Q71RC9 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SMIM5Q71RC9 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SMIM5Q71RC9 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SMIM5Q71RC9 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SMIM5Q71RC9 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SMIM5Q71RC9 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SMIM5Q71RC9 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
SMIM5Q71RC9 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
SMIM5Q71RC9 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SMIM5Q71RC9 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SMIM5Q71RC9 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SMIM5Q71RC9 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
SMIM5Q71RC9 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SMIM5Q71RC9 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SMIM5Q71RC9 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SMIM5Q71RC9 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SMIM5Q71RC9 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
SMIM5Q71RC9 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SMIM5Q71RC9 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SMIM5Q71RC9 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SMIM5Q71RC9 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SMIM5Q71RC9 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SMIM5Q71RC9 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SMIM5Q71RC9 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SMIM5Q71RC9 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SMIM5Q71RC9 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SMIM5Q71RC9 CHMP3-203ENST00000409225 1099 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SMIM5Q71RC9 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
SMIM5Q71RC9 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SMIM5Q71RC9 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SMIM5Q71RC9 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SMIM5Q71RC9 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SMIM5Q71RC9 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SMIM5Q71RC9 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SMIM5Q71RC9 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SMIM5Q71RC9 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SMIM5Q71RC9 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SMIM5Q71RC9 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SMIM5Q71RC9 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SMIM5Q71RC9 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
SMIM5Q71RC9 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SMIM5Q71RC9 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SMIM5Q71RC9 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SMIM5Q71RC9 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SMIM5Q71RC9 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SMIM5Q71RC9 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SMIM5Q71RC9 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SMIM5Q71RC9 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SMIM5Q71RC9 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SMIM5Q71RC9 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SMIM5Q71RC9 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.35
SMIM5Q71RC9 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SMIM5Q71RC9 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SMIM5Q71RC9 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SMIM5Q71RC9 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SMIM5Q71RC9 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SMIM5Q71RC9 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SMIM5Q71RC9 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SMIM5Q71RC9 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SMIM5Q71RC9 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SMIM5Q71RC9 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SMIM5Q71RC9 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SMIM5Q71RC9 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SMIM5Q71RC9 HMGN1P19-201ENST00000436976 333 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
SMIM5Q71RC9 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SMIM5Q71RC9 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SMIM5Q71RC9 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SMIM5Q71RC9 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SMIM5Q71RC9 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SMIM5Q71RC9 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
SMIM5Q71RC9 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SMIM5Q71RC9 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SMIM5Q71RC9 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SMIM5Q71RC9 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24 ms