Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZW49

PAXIP1, PAX-interacting protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,069 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAXIP1Q6ZW49 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PAXIP1Q6ZW49 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PAXIP1Q6ZW49 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PAXIP1Q6ZW49 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PAXIP1Q6ZW49 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PAXIP1Q6ZW49 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PAXIP1Q6ZW49 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PAXIP1Q6ZW49 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PAXIP1Q6ZW49 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PAXIP1Q6ZW49 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PAXIP1Q6ZW49 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
PAXIP1Q6ZW49 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PAXIP1Q6ZW49 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PAXIP1Q6ZW49 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PAXIP1Q6ZW49 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PAXIP1Q6ZW49 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PAXIP1Q6ZW49 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PAXIP1Q6ZW49 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PAXIP1Q6ZW49 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PAXIP1Q6ZW49 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
PAXIP1Q6ZW49 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
PAXIP1Q6ZW49 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
PAXIP1Q6ZW49 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PAXIP1Q6ZW49 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PAXIP1Q6ZW49 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PAXIP1Q6ZW49 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PAXIP1Q6ZW49 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PAXIP1Q6ZW49 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PAXIP1Q6ZW49 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PAXIP1Q6ZW49 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PAXIP1Q6ZW49 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PAXIP1Q6ZW49 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PAXIP1Q6ZW49 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PAXIP1Q6ZW49 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PAXIP1Q6ZW49 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PAXIP1Q6ZW49 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
PAXIP1Q6ZW49 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PAXIP1Q6ZW49 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PAXIP1Q6ZW49 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PAXIP1Q6ZW49 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PAXIP1Q6ZW49 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PAXIP1Q6ZW49 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PAXIP1Q6ZW49 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PAXIP1Q6ZW49 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
PAXIP1Q6ZW49 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PAXIP1Q6ZW49 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
PAXIP1Q6ZW49 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PAXIP1Q6ZW49 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PAXIP1Q6ZW49 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PAXIP1Q6ZW49 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PAXIP1Q6ZW49 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC22■■□□□ 1.11
PAXIP1Q6ZW49 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
PAXIP1Q6ZW49 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
PAXIP1Q6ZW49 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
PAXIP1Q6ZW49 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
PAXIP1Q6ZW49 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC22■■□□□ 1.11
PAXIP1Q6ZW49 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
PAXIP1Q6ZW49 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC22■■□□□ 1.11
PAXIP1Q6ZW49 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC22■■□□□ 1.11
PAXIP1Q6ZW49 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PAXIP1Q6ZW49 PRRG3-205ENST00000538575 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
PAXIP1Q6ZW49 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PAXIP1Q6ZW49 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PAXIP1Q6ZW49 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PAXIP1Q6ZW49 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PAXIP1Q6ZW49 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PAXIP1Q6ZW49 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PAXIP1Q6ZW49 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PAXIP1Q6ZW49 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PAXIP1Q6ZW49 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PAXIP1Q6ZW49 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PAXIP1Q6ZW49 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PAXIP1Q6ZW49 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PAXIP1Q6ZW49 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PAXIP1Q6ZW49 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PAXIP1Q6ZW49 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
PAXIP1Q6ZW49 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PAXIP1Q6ZW49 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PAXIP1Q6ZW49 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PAXIP1Q6ZW49 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PAXIP1Q6ZW49 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PAXIP1Q6ZW49 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PAXIP1Q6ZW49 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PAXIP1Q6ZW49 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PAXIP1Q6ZW49 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PAXIP1Q6ZW49 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PAXIP1Q6ZW49 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PAXIP1Q6ZW49 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PAXIP1Q6ZW49 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PAXIP1Q6ZW49 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PAXIP1Q6ZW49 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PAXIP1Q6ZW49 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PAXIP1Q6ZW49 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PAXIP1Q6ZW49 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PAXIP1Q6ZW49 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PAXIP1Q6ZW49 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
PAXIP1Q6ZW49 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
PAXIP1Q6ZW49 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PAXIP1Q6ZW49 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
PAXIP1Q6ZW49 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.4 ms