Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZT12

UBR3, E3 ubiquitin-protein ligase UBR3, humanhuman

Predictions only

Length 1,888 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBR3Q6ZT12 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
UBR3Q6ZT12 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
UBR3Q6ZT12 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
UBR3Q6ZT12 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
UBR3Q6ZT12 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
UBR3Q6ZT12 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
UBR3Q6ZT12 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
UBR3Q6ZT12 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
UBR3Q6ZT12 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
UBR3Q6ZT12 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
UBR3Q6ZT12 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
UBR3Q6ZT12 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
UBR3Q6ZT12 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
UBR3Q6ZT12 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
UBR3Q6ZT12 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
UBR3Q6ZT12 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
UBR3Q6ZT12 TMEM219-201ENST00000279396 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
UBR3Q6ZT12 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.34
UBR3Q6ZT12 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
UBR3Q6ZT12 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
UBR3Q6ZT12 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC23.39■■□□□ 1.34
UBR3Q6ZT12 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC23.39■■□□□ 1.34
UBR3Q6ZT12 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.39■■□□□ 1.34
UBR3Q6ZT12 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
UBR3Q6ZT12 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
UBR3Q6ZT12 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
UBR3Q6ZT12 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
UBR3Q6ZT12 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC23.39■■□□□ 1.33
UBR3Q6ZT12 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
UBR3Q6ZT12 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
UBR3Q6ZT12 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
UBR3Q6ZT12 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC23.39■■□□□ 1.33
UBR3Q6ZT12 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
UBR3Q6ZT12 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
UBR3Q6ZT12 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
UBR3Q6ZT12 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
UBR3Q6ZT12 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
UBR3Q6ZT12 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
UBR3Q6ZT12 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
UBR3Q6ZT12 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
UBR3Q6ZT12 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
UBR3Q6ZT12 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
UBR3Q6ZT12 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
UBR3Q6ZT12 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
UBR3Q6ZT12 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
UBR3Q6ZT12 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
UBR3Q6ZT12 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
UBR3Q6ZT12 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
UBR3Q6ZT12 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
UBR3Q6ZT12 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
UBR3Q6ZT12 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
UBR3Q6ZT12 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
UBR3Q6ZT12 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
UBR3Q6ZT12 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
UBR3Q6ZT12 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
UBR3Q6ZT12 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
UBR3Q6ZT12 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
UBR3Q6ZT12 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
UBR3Q6ZT12 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
UBR3Q6ZT12 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
UBR3Q6ZT12 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
UBR3Q6ZT12 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
UBR3Q6ZT12 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
UBR3Q6ZT12 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
UBR3Q6ZT12 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
UBR3Q6ZT12 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
UBR3Q6ZT12 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
UBR3Q6ZT12 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
UBR3Q6ZT12 FAM172A-207ENST00000509739 1031 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
UBR3Q6ZT12 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
UBR3Q6ZT12 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
UBR3Q6ZT12 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
UBR3Q6ZT12 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
UBR3Q6ZT12 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
UBR3Q6ZT12 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
UBR3Q6ZT12 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
UBR3Q6ZT12 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
UBR3Q6ZT12 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
UBR3Q6ZT12 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
UBR3Q6ZT12 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
UBR3Q6ZT12 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
UBR3Q6ZT12 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC23.36■■□□□ 1.33
UBR3Q6ZT12 GGCT-205ENST00000409436 954 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
UBR3Q6ZT12 RFX3-AS1-201ENST00000423112 552 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
UBR3Q6ZT12 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
UBR3Q6ZT12 MCF2L-AS1-201ENST00000446789 712 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
UBR3Q6ZT12 AL355385.1-201ENST00000606123 409 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
UBR3Q6ZT12 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
UBR3Q6ZT12 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
UBR3Q6ZT12 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
UBR3Q6ZT12 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
UBR3Q6ZT12 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
UBR3Q6ZT12 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
UBR3Q6ZT12 RPS27L-204ENST00000455271 923 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
UBR3Q6ZT12 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
UBR3Q6ZT12 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
UBR3Q6ZT12 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
UBR3Q6ZT12 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
UBR3Q6ZT12 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
UBR3Q6ZT12 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
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