Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZMZ3

SYNE3, Nesprin-3, humanhuman

Predictions only

Length 975 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNE3Q6ZMZ3 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SYNE3Q6ZMZ3 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SYNE3Q6ZMZ3 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SYNE3Q6ZMZ3 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SYNE3Q6ZMZ3 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
SYNE3Q6ZMZ3 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SYNE3Q6ZMZ3 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SYNE3Q6ZMZ3 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SYNE3Q6ZMZ3 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SYNE3Q6ZMZ3 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SYNE3Q6ZMZ3 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SYNE3Q6ZMZ3 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SYNE3Q6ZMZ3 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SYNE3Q6ZMZ3 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SYNE3Q6ZMZ3 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
SYNE3Q6ZMZ3 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SYNE3Q6ZMZ3 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SYNE3Q6ZMZ3 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SYNE3Q6ZMZ3 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SYNE3Q6ZMZ3 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SYNE3Q6ZMZ3 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SYNE3Q6ZMZ3 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
SYNE3Q6ZMZ3 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
SYNE3Q6ZMZ3 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SYNE3Q6ZMZ3 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SYNE3Q6ZMZ3 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SYNE3Q6ZMZ3 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SYNE3Q6ZMZ3 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SYNE3Q6ZMZ3 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SYNE3Q6ZMZ3 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SYNE3Q6ZMZ3 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SYNE3Q6ZMZ3 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SYNE3Q6ZMZ3 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SYNE3Q6ZMZ3 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
SYNE3Q6ZMZ3 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SYNE3Q6ZMZ3 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SYNE3Q6ZMZ3 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SYNE3Q6ZMZ3 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SYNE3Q6ZMZ3 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SYNE3Q6ZMZ3 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SYNE3Q6ZMZ3 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SYNE3Q6ZMZ3 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SYNE3Q6ZMZ3 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SYNE3Q6ZMZ3 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SYNE3Q6ZMZ3 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
SYNE3Q6ZMZ3 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SYNE3Q6ZMZ3 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SYNE3Q6ZMZ3 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SYNE3Q6ZMZ3 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SYNE3Q6ZMZ3 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SYNE3Q6ZMZ3 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SYNE3Q6ZMZ3 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SYNE3Q6ZMZ3 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
SYNE3Q6ZMZ3 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
SYNE3Q6ZMZ3 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
SYNE3Q6ZMZ3 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SYNE3Q6ZMZ3 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SYNE3Q6ZMZ3 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
SYNE3Q6ZMZ3 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
SYNE3Q6ZMZ3 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SYNE3Q6ZMZ3 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SYNE3Q6ZMZ3 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SYNE3Q6ZMZ3 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SYNE3Q6ZMZ3 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SYNE3Q6ZMZ3 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SYNE3Q6ZMZ3 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SYNE3Q6ZMZ3 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SYNE3Q6ZMZ3 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SYNE3Q6ZMZ3 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SYNE3Q6ZMZ3 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SYNE3Q6ZMZ3 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SYNE3Q6ZMZ3 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SYNE3Q6ZMZ3 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SYNE3Q6ZMZ3 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SYNE3Q6ZMZ3 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SYNE3Q6ZMZ3 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SYNE3Q6ZMZ3 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SYNE3Q6ZMZ3 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SYNE3Q6ZMZ3 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SYNE3Q6ZMZ3 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SYNE3Q6ZMZ3 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SYNE3Q6ZMZ3 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SYNE3Q6ZMZ3 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SYNE3Q6ZMZ3 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SYNE3Q6ZMZ3 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SYNE3Q6ZMZ3 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SYNE3Q6ZMZ3 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SYNE3Q6ZMZ3 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SYNE3Q6ZMZ3 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SYNE3Q6ZMZ3 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SYNE3Q6ZMZ3 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SYNE3Q6ZMZ3 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SYNE3Q6ZMZ3 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SYNE3Q6ZMZ3 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SYNE3Q6ZMZ3 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SYNE3Q6ZMZ3 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SYNE3Q6ZMZ3 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SYNE3Q6ZMZ3 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SYNE3Q6ZMZ3 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SYNE3Q6ZMZ3 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.6 ms