Protein–RNA interactions for Protein: Q6TFL3

CCDC171, Coiled-coil domain-containing protein 171, humanhuman

Predictions only

Length 1,326 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC171Q6TFL3 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC171Q6TFL3 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC171Q6TFL3 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC171Q6TFL3 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC171Q6TFL3 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC171Q6TFL3 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC171Q6TFL3 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC171Q6TFL3 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC171Q6TFL3 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC171Q6TFL3 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC171Q6TFL3 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC171Q6TFL3 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC171Q6TFL3 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC171Q6TFL3 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC171Q6TFL3 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC171Q6TFL3 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC171Q6TFL3 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC171Q6TFL3 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC171Q6TFL3 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC171Q6TFL3 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC171Q6TFL3 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC171Q6TFL3 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC171Q6TFL3 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC171Q6TFL3 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC171Q6TFL3 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC171Q6TFL3 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC171Q6TFL3 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC171Q6TFL3 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC171Q6TFL3 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC171Q6TFL3 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC171Q6TFL3 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC171Q6TFL3 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC171Q6TFL3 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC171Q6TFL3 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC171Q6TFL3 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC171Q6TFL3 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC171Q6TFL3 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC171Q6TFL3 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC171Q6TFL3 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC171Q6TFL3 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC171Q6TFL3 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC171Q6TFL3 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC171Q6TFL3 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC171Q6TFL3 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC171Q6TFL3 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC171Q6TFL3 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC171Q6TFL3 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC171Q6TFL3 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC171Q6TFL3 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC171Q6TFL3 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC171Q6TFL3 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC171Q6TFL3 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC171Q6TFL3 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC171Q6TFL3 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC171Q6TFL3 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC171Q6TFL3 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC171Q6TFL3 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC171Q6TFL3 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC171Q6TFL3 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC171Q6TFL3 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC171Q6TFL3 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC171Q6TFL3 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC171Q6TFL3 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC171Q6TFL3 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC171Q6TFL3 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC171Q6TFL3 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC171Q6TFL3 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC171Q6TFL3 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC171Q6TFL3 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC171Q6TFL3 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC171Q6TFL3 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC171Q6TFL3 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC171Q6TFL3 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC171Q6TFL3 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC171Q6TFL3 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC171Q6TFL3 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC171Q6TFL3 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC171Q6TFL3 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC171Q6TFL3 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC171Q6TFL3 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC171Q6TFL3 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC171Q6TFL3 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC171Q6TFL3 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC171Q6TFL3 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC171Q6TFL3 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC171Q6TFL3 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC171Q6TFL3 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC171Q6TFL3 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC171Q6TFL3 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC171Q6TFL3 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC171Q6TFL3 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC171Q6TFL3 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC171Q6TFL3 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC171Q6TFL3 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC171Q6TFL3 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC171Q6TFL3 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC171Q6TFL3 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC171Q6TFL3 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC171Q6TFL3 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC171Q6TFL3 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.7 ms