Protein–RNA interactions for Protein: Q5VX71

SUSD4, Sushi domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 490 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUSD4Q5VX71 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SUSD4Q5VX71 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SUSD4Q5VX71 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SUSD4Q5VX71 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SUSD4Q5VX71 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SUSD4Q5VX71 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
SUSD4Q5VX71 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SUSD4Q5VX71 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SUSD4Q5VX71 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SUSD4Q5VX71 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SUSD4Q5VX71 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SUSD4Q5VX71 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SUSD4Q5VX71 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SUSD4Q5VX71 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SUSD4Q5VX71 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SUSD4Q5VX71 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SUSD4Q5VX71 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SUSD4Q5VX71 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
SUSD4Q5VX71 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SUSD4Q5VX71 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SUSD4Q5VX71 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SUSD4Q5VX71 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SUSD4Q5VX71 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
SUSD4Q5VX71 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SUSD4Q5VX71 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
SUSD4Q5VX71 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SUSD4Q5VX71 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SUSD4Q5VX71 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SUSD4Q5VX71 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SUSD4Q5VX71 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SUSD4Q5VX71 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SUSD4Q5VX71 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SUSD4Q5VX71 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SUSD4Q5VX71 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SUSD4Q5VX71 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC23.2■■□□□ 1.31
SUSD4Q5VX71 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
SUSD4Q5VX71 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SUSD4Q5VX71 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SUSD4Q5VX71 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SUSD4Q5VX71 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SUSD4Q5VX71 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SUSD4Q5VX71 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SUSD4Q5VX71 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SUSD4Q5VX71 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
SUSD4Q5VX71 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
SUSD4Q5VX71 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SUSD4Q5VX71 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SUSD4Q5VX71 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
SUSD4Q5VX71 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SUSD4Q5VX71 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SUSD4Q5VX71 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
SUSD4Q5VX71 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
SUSD4Q5VX71 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SUSD4Q5VX71 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SUSD4Q5VX71 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SUSD4Q5VX71 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
SUSD4Q5VX71 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
SUSD4Q5VX71 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SUSD4Q5VX71 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SUSD4Q5VX71 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SUSD4Q5VX71 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SUSD4Q5VX71 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
SUSD4Q5VX71 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SUSD4Q5VX71 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SUSD4Q5VX71 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SUSD4Q5VX71 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
SUSD4Q5VX71 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SUSD4Q5VX71 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
SUSD4Q5VX71 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SUSD4Q5VX71 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SUSD4Q5VX71 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SUSD4Q5VX71 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SUSD4Q5VX71 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SUSD4Q5VX71 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SUSD4Q5VX71 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SUSD4Q5VX71 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SUSD4Q5VX71 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SUSD4Q5VX71 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SUSD4Q5VX71 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SUSD4Q5VX71 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SUSD4Q5VX71 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SUSD4Q5VX71 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
SUSD4Q5VX71 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
SUSD4Q5VX71 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SUSD4Q5VX71 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SUSD4Q5VX71 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SUSD4Q5VX71 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SUSD4Q5VX71 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SUSD4Q5VX71 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SUSD4Q5VX71 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SUSD4Q5VX71 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SUSD4Q5VX71 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SUSD4Q5VX71 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SUSD4Q5VX71 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SUSD4Q5VX71 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SUSD4Q5VX71 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SUSD4Q5VX71 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SUSD4Q5VX71 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SUSD4Q5VX71 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SUSD4Q5VX71 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 108.9 ms