Protein–RNA interactions for Protein: Q15878

CACNA1E, Voltage-dependent R-type calcium channel subunit alpha-1E, humanhuman

Predictions only

Length 2,313 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1EQ15878 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CACNA1EQ15878 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CACNA1EQ15878 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CACNA1EQ15878 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CACNA1EQ15878 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
CACNA1EQ15878 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CACNA1EQ15878 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CACNA1EQ15878 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CACNA1EQ15878 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CACNA1EQ15878 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CACNA1EQ15878 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CACNA1EQ15878 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CACNA1EQ15878 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CACNA1EQ15878 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CACNA1EQ15878 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CACNA1EQ15878 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CACNA1EQ15878 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CACNA1EQ15878 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CACNA1EQ15878 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CACNA1EQ15878 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CACNA1EQ15878 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CACNA1EQ15878 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CACNA1EQ15878 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CACNA1EQ15878 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CACNA1EQ15878 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CACNA1EQ15878 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CACNA1EQ15878 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CACNA1EQ15878 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CACNA1EQ15878 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CACNA1EQ15878 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CACNA1EQ15878 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CACNA1EQ15878 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CACNA1EQ15878 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CACNA1EQ15878 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CACNA1EQ15878 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
CACNA1EQ15878 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CACNA1EQ15878 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CACNA1EQ15878 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CACNA1EQ15878 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CACNA1EQ15878 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CACNA1EQ15878 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
CACNA1EQ15878 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CACNA1EQ15878 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CACNA1EQ15878 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CACNA1EQ15878 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
CACNA1EQ15878 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CACNA1EQ15878 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CACNA1EQ15878 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
CACNA1EQ15878 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CACNA1EQ15878 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CACNA1EQ15878 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
CACNA1EQ15878 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CACNA1EQ15878 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CACNA1EQ15878 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CACNA1EQ15878 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CACNA1EQ15878 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CACNA1EQ15878 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CACNA1EQ15878 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
CACNA1EQ15878 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CACNA1EQ15878 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CACNA1EQ15878 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CACNA1EQ15878 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CACNA1EQ15878 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CACNA1EQ15878 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CACNA1EQ15878 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CACNA1EQ15878 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CACNA1EQ15878 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CACNA1EQ15878 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CACNA1EQ15878 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CACNA1EQ15878 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CACNA1EQ15878 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CACNA1EQ15878 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CACNA1EQ15878 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CACNA1EQ15878 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CACNA1EQ15878 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CACNA1EQ15878 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CACNA1EQ15878 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CACNA1EQ15878 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CACNA1EQ15878 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
CACNA1EQ15878 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CACNA1EQ15878 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CACNA1EQ15878 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
CACNA1EQ15878 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CACNA1EQ15878 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CACNA1EQ15878 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CACNA1EQ15878 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CACNA1EQ15878 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CACNA1EQ15878 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
CACNA1EQ15878 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CACNA1EQ15878 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CACNA1EQ15878 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CACNA1EQ15878 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CACNA1EQ15878 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CACNA1EQ15878 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CACNA1EQ15878 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CACNA1EQ15878 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CACNA1EQ15878 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CACNA1EQ15878 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CACNA1EQ15878 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CACNA1EQ15878 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
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