Protein–RNA interactions for Protein: Q15517

CDSN, Corneodesmosin, humanhuman

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Length 529 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDSNQ15517 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CDSNQ15517 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CDSNQ15517 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
CDSNQ15517 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
CDSNQ15517 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CDSNQ15517 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CDSNQ15517 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CDSNQ15517 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CDSNQ15517 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CDSNQ15517 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CDSNQ15517 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CDSNQ15517 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CDSNQ15517 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CDSNQ15517 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CDSNQ15517 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CDSNQ15517 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CDSNQ15517 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CDSNQ15517 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CDSNQ15517 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CDSNQ15517 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CDSNQ15517 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CDSNQ15517 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CDSNQ15517 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CDSNQ15517 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CDSNQ15517 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CDSNQ15517 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CDSNQ15517 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CDSNQ15517 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CDSNQ15517 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CDSNQ15517 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
CDSNQ15517 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CDSNQ15517 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CDSNQ15517 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CDSNQ15517 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CDSNQ15517 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
CDSNQ15517 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
CDSNQ15517 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CDSNQ15517 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
CDSNQ15517 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CDSNQ15517 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
CDSNQ15517 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CDSNQ15517 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CDSNQ15517 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CDSNQ15517 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CDSNQ15517 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CDSNQ15517 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CDSNQ15517 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
CDSNQ15517 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CDSNQ15517 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CDSNQ15517 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CDSNQ15517 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CDSNQ15517 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CDSNQ15517 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CDSNQ15517 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CDSNQ15517 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CDSNQ15517 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CDSNQ15517 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
CDSNQ15517 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CDSNQ15517 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CDSNQ15517 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CDSNQ15517 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CDSNQ15517 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
CDSNQ15517 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CDSNQ15517 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
CDSNQ15517 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CDSNQ15517 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CDSNQ15517 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CDSNQ15517 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CDSNQ15517 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CDSNQ15517 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CDSNQ15517 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CDSNQ15517 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CDSNQ15517 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CDSNQ15517 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CDSNQ15517 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CDSNQ15517 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
CDSNQ15517 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CDSNQ15517 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CDSNQ15517 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CDSNQ15517 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CDSNQ15517 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CDSNQ15517 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CDSNQ15517 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CDSNQ15517 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CDSNQ15517 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CDSNQ15517 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CDSNQ15517 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CDSNQ15517 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CDSNQ15517 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CDSNQ15517 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CDSNQ15517 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
CDSNQ15517 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CDSNQ15517 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
CDSNQ15517 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
CDSNQ15517 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CDSNQ15517 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CDSNQ15517 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
CDSNQ15517 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CDSNQ15517 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CDSNQ15517 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
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