Protein–RNA interactions for Protein: Q14031

COL4A6, Collagen alpha-6(IV) chain, humanhuman

Predictions only

Length 1,691 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL4A6Q14031 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
COL4A6Q14031 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
COL4A6Q14031 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC19.87■□□□□ 0.77
COL4A6Q14031 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
COL4A6Q14031 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
COL4A6Q14031 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
COL4A6Q14031 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
COL4A6Q14031 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
COL4A6Q14031 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
COL4A6Q14031 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
COL4A6Q14031 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
COL4A6Q14031 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
COL4A6Q14031 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
COL4A6Q14031 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
COL4A6Q14031 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
COL4A6Q14031 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
COL4A6Q14031 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
COL4A6Q14031 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
COL4A6Q14031 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
COL4A6Q14031 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
COL4A6Q14031 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC19.86■□□□□ 0.77
COL4A6Q14031 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
COL4A6Q14031 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
COL4A6Q14031 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
COL4A6Q14031 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
COL4A6Q14031 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
COL4A6Q14031 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
COL4A6Q14031 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
COL4A6Q14031 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
COL4A6Q14031 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
COL4A6Q14031 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
COL4A6Q14031 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
COL4A6Q14031 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
COL4A6Q14031 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
COL4A6Q14031 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
COL4A6Q14031 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
COL4A6Q14031 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
COL4A6Q14031 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
COL4A6Q14031 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC19.85■□□□□ 0.77
COL4A6Q14031 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
COL4A6Q14031 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
COL4A6Q14031 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
COL4A6Q14031 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
COL4A6Q14031 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
COL4A6Q14031 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
COL4A6Q14031 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
COL4A6Q14031 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
COL4A6Q14031 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
COL4A6Q14031 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
COL4A6Q14031 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
COL4A6Q14031 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
COL4A6Q14031 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
COL4A6Q14031 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
COL4A6Q14031 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC19.84■□□□□ 0.77
COL4A6Q14031 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
COL4A6Q14031 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
COL4A6Q14031 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
COL4A6Q14031 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC19.84■□□□□ 0.77
COL4A6Q14031 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
COL4A6Q14031 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
COL4A6Q14031 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
COL4A6Q14031 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
COL4A6Q14031 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
COL4A6Q14031 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
COL4A6Q14031 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
COL4A6Q14031 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
COL4A6Q14031 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
COL4A6Q14031 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
COL4A6Q14031 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
COL4A6Q14031 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
COL4A6Q14031 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
COL4A6Q14031 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
COL4A6Q14031 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
COL4A6Q14031 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
COL4A6Q14031 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
COL4A6Q14031 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
COL4A6Q14031 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
COL4A6Q14031 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC19.83■□□□□ 0.76
COL4A6Q14031 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
COL4A6Q14031 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC19.83■□□□□ 0.76
COL4A6Q14031 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
COL4A6Q14031 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
COL4A6Q14031 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC19.83■□□□□ 0.76
COL4A6Q14031 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
COL4A6Q14031 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
COL4A6Q14031 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
COL4A6Q14031 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC19.83■□□□□ 0.76
COL4A6Q14031 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
COL4A6Q14031 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC19.83■□□□□ 0.76
COL4A6Q14031 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
COL4A6Q14031 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
COL4A6Q14031 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
COL4A6Q14031 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
COL4A6Q14031 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
COL4A6Q14031 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
COL4A6Q14031 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
COL4A6Q14031 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
COL4A6Q14031 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
COL4A6Q14031 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
COL4A6Q14031 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.8 ms