Protein–RNA interactions for Protein: Q13568

IRF5, Interferon regulatory factor 5, humanhuman

Predictions only

Length 498 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRF5Q13568 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC21■□□□□ 0.95
IRF5Q13568 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
IRF5Q13568 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
IRF5Q13568 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
IRF5Q13568 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
IRF5Q13568 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
IRF5Q13568 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
IRF5Q13568 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
IRF5Q13568 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
IRF5Q13568 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
IRF5Q13568 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
IRF5Q13568 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
IRF5Q13568 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
IRF5Q13568 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
IRF5Q13568 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
IRF5Q13568 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
IRF5Q13568 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
IRF5Q13568 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
IRF5Q13568 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
IRF5Q13568 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC20.99■□□□□ 0.95
IRF5Q13568 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
IRF5Q13568 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
IRF5Q13568 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
IRF5Q13568 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
IRF5Q13568 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
IRF5Q13568 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
IRF5Q13568 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
IRF5Q13568 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
IRF5Q13568 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
IRF5Q13568 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
IRF5Q13568 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
IRF5Q13568 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
IRF5Q13568 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
IRF5Q13568 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
IRF5Q13568 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
IRF5Q13568 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
IRF5Q13568 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
IRF5Q13568 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
IRF5Q13568 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
IRF5Q13568 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
IRF5Q13568 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
IRF5Q13568 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
IRF5Q13568 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
IRF5Q13568 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
IRF5Q13568 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
IRF5Q13568 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
IRF5Q13568 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
IRF5Q13568 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
IRF5Q13568 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
IRF5Q13568 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
IRF5Q13568 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
IRF5Q13568 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
IRF5Q13568 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
IRF5Q13568 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
IRF5Q13568 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
IRF5Q13568 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
IRF5Q13568 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
IRF5Q13568 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
IRF5Q13568 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
IRF5Q13568 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
IRF5Q13568 GLIPR1L1-202ENST00000378695 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
IRF5Q13568 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
IRF5Q13568 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
IRF5Q13568 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
IRF5Q13568 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
IRF5Q13568 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
IRF5Q13568 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
IRF5Q13568 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
IRF5Q13568 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
IRF5Q13568 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
IRF5Q13568 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
IRF5Q13568 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
IRF5Q13568 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
IRF5Q13568 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
IRF5Q13568 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
IRF5Q13568 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
IRF5Q13568 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
IRF5Q13568 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
IRF5Q13568 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
IRF5Q13568 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
IRF5Q13568 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
IRF5Q13568 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
IRF5Q13568 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
IRF5Q13568 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
IRF5Q13568 RFX3-AS1-201ENST00000423112 552 ntTSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
IRF5Q13568 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
IRF5Q13568 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
IRF5Q13568 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
IRF5Q13568 FAM172A-207ENST00000509739 1031 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
IRF5Q13568 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
IRF5Q13568 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
IRF5Q13568 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
IRF5Q13568 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
IRF5Q13568 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
IRF5Q13568 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
IRF5Q13568 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
IRF5Q13568 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
IRF5Q13568 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
IRF5Q13568 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
IRF5Q13568 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.6 ms