Protein–RNA interactions for Protein: Q08289

CACNB2, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit beta-2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 660 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNB2Q08289 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
CACNB2Q08289 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CACNB2Q08289 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CACNB2Q08289 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CACNB2Q08289 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CACNB2Q08289 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CACNB2Q08289 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CACNB2Q08289 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
CACNB2Q08289 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CACNB2Q08289 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CACNB2Q08289 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
CACNB2Q08289 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CACNB2Q08289 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
CACNB2Q08289 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC20.91■□□□□ 0.94
CACNB2Q08289 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
CACNB2Q08289 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
CACNB2Q08289 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
CACNB2Q08289 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CACNB2Q08289 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
CACNB2Q08289 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CACNB2Q08289 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CACNB2Q08289 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
CACNB2Q08289 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
CACNB2Q08289 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
CACNB2Q08289 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
CACNB2Q08289 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CACNB2Q08289 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CACNB2Q08289 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CACNB2Q08289 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
CACNB2Q08289 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
CACNB2Q08289 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
CACNB2Q08289 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
CACNB2Q08289 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CACNB2Q08289 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CACNB2Q08289 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
CACNB2Q08289 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CACNB2Q08289 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CACNB2Q08289 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CACNB2Q08289 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
CACNB2Q08289 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CACNB2Q08289 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CACNB2Q08289 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
CACNB2Q08289 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
CACNB2Q08289 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
CACNB2Q08289 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CACNB2Q08289 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
CACNB2Q08289 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
CACNB2Q08289 AC008481.3-201ENST00000585656 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
CACNB2Q08289 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
CACNB2Q08289 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
CACNB2Q08289 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
CACNB2Q08289 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
CACNB2Q08289 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
CACNB2Q08289 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
CACNB2Q08289 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CACNB2Q08289 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CACNB2Q08289 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CACNB2Q08289 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CACNB2Q08289 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CACNB2Q08289 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
CACNB2Q08289 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
CACNB2Q08289 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.94
CACNB2Q08289 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.89■□□□□ 0.94
CACNB2Q08289 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
CACNB2Q08289 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
CACNB2Q08289 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
CACNB2Q08289 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
CACNB2Q08289 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
CACNB2Q08289 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
CACNB2Q08289 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
CACNB2Q08289 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
CACNB2Q08289 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC20.89■□□□□ 0.93
CACNB2Q08289 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
CACNB2Q08289 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
CACNB2Q08289 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
CACNB2Q08289 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
CACNB2Q08289 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
CACNB2Q08289 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
CACNB2Q08289 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
CACNB2Q08289 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
CACNB2Q08289 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
CACNB2Q08289 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
CACNB2Q08289 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CACNB2Q08289 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CACNB2Q08289 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CACNB2Q08289 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CACNB2Q08289 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
CACNB2Q08289 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
CACNB2Q08289 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC20.88■□□□□ 0.93
CACNB2Q08289 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
CACNB2Q08289 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
CACNB2Q08289 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
CACNB2Q08289 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
CACNB2Q08289 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
CACNB2Q08289 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
CACNB2Q08289 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CACNB2Q08289 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CACNB2Q08289 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CACNB2Q08289 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CACNB2Q08289 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.4 ms