Protein–RNA interactions for Protein: Q06323

PSME1, Proteasome activator complex subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSME1Q06323 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PSME1Q06323 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
PSME1Q06323 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PSME1Q06323 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PSME1Q06323 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PSME1Q06323 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
PSME1Q06323 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PSME1Q06323 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PSME1Q06323 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PSME1Q06323 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PSME1Q06323 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PSME1Q06323 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PSME1Q06323 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PSME1Q06323 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PSME1Q06323 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PSME1Q06323 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PSME1Q06323 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PSME1Q06323 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PSME1Q06323 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PSME1Q06323 AC008481.3-201ENST00000585656 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PSME1Q06323 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PSME1Q06323 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PSME1Q06323 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PSME1Q06323 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PSME1Q06323 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PSME1Q06323 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PSME1Q06323 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
PSME1Q06323 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PSME1Q06323 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PSME1Q06323 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
PSME1Q06323 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PSME1Q06323 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PSME1Q06323 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
PSME1Q06323 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
PSME1Q06323 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PSME1Q06323 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
PSME1Q06323 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
PSME1Q06323 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC25.33■■□□□ 1.65
PSME1Q06323 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
PSME1Q06323 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
PSME1Q06323 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
PSME1Q06323 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PSME1Q06323 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PSME1Q06323 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PSME1Q06323 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PSME1Q06323 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PSME1Q06323 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PSME1Q06323 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PSME1Q06323 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PSME1Q06323 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PSME1Q06323 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PSME1Q06323 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PSME1Q06323 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PSME1Q06323 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PSME1Q06323 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PSME1Q06323 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PSME1Q06323 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PSME1Q06323 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PSME1Q06323 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PSME1Q06323 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
PSME1Q06323 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PSME1Q06323 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PSME1Q06323 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
PSME1Q06323 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PSME1Q06323 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PSME1Q06323 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PSME1Q06323 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PSME1Q06323 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PSME1Q06323 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PSME1Q06323 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PSME1Q06323 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PSME1Q06323 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PSME1Q06323 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PSME1Q06323 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PSME1Q06323 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PSME1Q06323 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
PSME1Q06323 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PSME1Q06323 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
PSME1Q06323 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PSME1Q06323 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PSME1Q06323 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PSME1Q06323 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PSME1Q06323 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PSME1Q06323 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PSME1Q06323 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PSME1Q06323 AC092183.1-201ENST00000469884 875 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
PSME1Q06323 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
PSME1Q06323 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PSME1Q06323 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
PSME1Q06323 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PSME1Q06323 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PSME1Q06323 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PSME1Q06323 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PSME1Q06323 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PSME1Q06323 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PSME1Q06323 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PSME1Q06323 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PSME1Q06323 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PSME1Q06323 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PSME1Q06323 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms