Protein–RNA interactions for Protein: Q01518

CAP1, Adenylyl cyclase-associated protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAP1Q01518 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CAP1Q01518 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CAP1Q01518 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CAP1Q01518 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CAP1Q01518 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CAP1Q01518 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CAP1Q01518 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CAP1Q01518 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
CAP1Q01518 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CAP1Q01518 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CAP1Q01518 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CAP1Q01518 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CAP1Q01518 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
CAP1Q01518 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CAP1Q01518 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CAP1Q01518 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CAP1Q01518 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CAP1Q01518 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CAP1Q01518 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CAP1Q01518 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CAP1Q01518 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CAP1Q01518 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CAP1Q01518 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CAP1Q01518 LEKR1-211ENST00000498839 616 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CAP1Q01518 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CAP1Q01518 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CAP1Q01518 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
CAP1Q01518 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CAP1Q01518 AL157832.3-201ENST00000635764 1005 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CAP1Q01518 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
CAP1Q01518 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
CAP1Q01518 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
CAP1Q01518 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
CAP1Q01518 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC21.08■□□□□ 0.96
CAP1Q01518 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
CAP1Q01518 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
CAP1Q01518 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.96
CAP1Q01518 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CAP1Q01518 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CAP1Q01518 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CAP1Q01518 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CAP1Q01518 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CAP1Q01518 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CAP1Q01518 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CAP1Q01518 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CAP1Q01518 AC007364.1-201ENST00000449714 1022 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CAP1Q01518 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CAP1Q01518 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CAP1Q01518 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CAP1Q01518 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CAP1Q01518 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CAP1Q01518 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CAP1Q01518 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CAP1Q01518 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CAP1Q01518 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CAP1Q01518 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CAP1Q01518 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CAP1Q01518 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
CAP1Q01518 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CAP1Q01518 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CAP1Q01518 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CAP1Q01518 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CAP1Q01518 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CAP1Q01518 AC004967.1-201ENST00000453589 447 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
CAP1Q01518 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CAP1Q01518 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CAP1Q01518 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CAP1Q01518 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CAP1Q01518 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
CAP1Q01518 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CAP1Q01518 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CAP1Q01518 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CAP1Q01518 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CAP1Q01518 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CAP1Q01518 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
CAP1Q01518 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CAP1Q01518 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CAP1Q01518 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CAP1Q01518 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CAP1Q01518 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CAP1Q01518 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CAP1Q01518 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CAP1Q01518 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CAP1Q01518 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CAP1Q01518 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CAP1Q01518 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
CAP1Q01518 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CAP1Q01518 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
CAP1Q01518 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CAP1Q01518 AC130456.4-201ENST00000568635 665 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CAP1Q01518 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CAP1Q01518 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CAP1Q01518 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CAP1Q01518 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CAP1Q01518 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CAP1Q01518 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CAP1Q01518 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CAP1Q01518 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CAP1Q01518 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CAP1Q01518 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms