Protein–RNA interactions for Protein: P33527

ABCC1, Multidrug resistance-associated protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,531 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCC1P33527 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
ABCC1P33527 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
ABCC1P33527 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC27.97■■■□□ 2.07
ABCC1P33527 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
ABCC1P33527 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
ABCC1P33527 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
ABCC1P33527 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
ABCC1P33527 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
ABCC1P33527 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
ABCC1P33527 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
ABCC1P33527 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
ABCC1P33527 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
ABCC1P33527 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
ABCC1P33527 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
ABCC1P33527 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
ABCC1P33527 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC27.96■■■□□ 2.07
ABCC1P33527 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
ABCC1P33527 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC27.96■■■□□ 2.07
ABCC1P33527 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC27.96■■■□□ 2.07
ABCC1P33527 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC27.96■■■□□ 2.07
ABCC1P33527 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.96■■■□□ 2.07
ABCC1P33527 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
ABCC1P33527 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
ABCC1P33527 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
ABCC1P33527 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
ABCC1P33527 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
ABCC1P33527 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
ABCC1P33527 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
ABCC1P33527 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
ABCC1P33527 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
ABCC1P33527 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.07
ABCC1P33527 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC27.95■■■□□ 2.07
ABCC1P33527 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
ABCC1P33527 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
ABCC1P33527 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
ABCC1P33527 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
ABCC1P33527 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
ABCC1P33527 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
ABCC1P33527 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
ABCC1P33527 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
ABCC1P33527 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
ABCC1P33527 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
ABCC1P33527 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
ABCC1P33527 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC27.94■■■□□ 2.06
ABCC1P33527 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC27.94■■■□□ 2.06
ABCC1P33527 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
ABCC1P33527 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
ABCC1P33527 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
ABCC1P33527 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
ABCC1P33527 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
ABCC1P33527 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
ABCC1P33527 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
ABCC1P33527 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
ABCC1P33527 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
ABCC1P33527 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
ABCC1P33527 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
ABCC1P33527 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
ABCC1P33527 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC27.93■■■□□ 2.06
ABCC1P33527 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC27.93■■■□□ 2.06
ABCC1P33527 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
ABCC1P33527 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
ABCC1P33527 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
ABCC1P33527 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
ABCC1P33527 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
ABCC1P33527 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
ABCC1P33527 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
ABCC1P33527 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
ABCC1P33527 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
ABCC1P33527 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC27.93■■■□□ 2.06
ABCC1P33527 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
ABCC1P33527 SPCS1-201ENST00000233025 1082 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
ABCC1P33527 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
ABCC1P33527 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
ABCC1P33527 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
ABCC1P33527 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
ABCC1P33527 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
ABCC1P33527 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
ABCC1P33527 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
ABCC1P33527 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
ABCC1P33527 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
ABCC1P33527 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
ABCC1P33527 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
ABCC1P33527 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
ABCC1P33527 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
ABCC1P33527 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
ABCC1P33527 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
ABCC1P33527 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC27.92■■■□□ 2.06
ABCC1P33527 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
ABCC1P33527 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
ABCC1P33527 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
ABCC1P33527 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
ABCC1P33527 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
ABCC1P33527 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
ABCC1P33527 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
ABCC1P33527 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
ABCC1P33527 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
ABCC1P33527 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
ABCC1P33527 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
ABCC1P33527 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
ABCC1P33527 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.3 ms