Protein–RNA interactions for Protein: P13378

HOXD8, Homeobox protein Hox-D8, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 290 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD8P13378 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
HOXD8P13378 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
HOXD8P13378 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
HOXD8P13378 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
HOXD8P13378 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
HOXD8P13378 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
HOXD8P13378 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
HOXD8P13378 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
HOXD8P13378 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
HOXD8P13378 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
HOXD8P13378 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
HOXD8P13378 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
HOXD8P13378 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
HOXD8P13378 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
HOXD8P13378 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
HOXD8P13378 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
HOXD8P13378 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC20.6■□□□□ 0.89
HOXD8P13378 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
HOXD8P13378 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
HOXD8P13378 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
HOXD8P13378 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
HOXD8P13378 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
HOXD8P13378 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
HOXD8P13378 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
HOXD8P13378 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
HOXD8P13378 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
HOXD8P13378 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
HOXD8P13378 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC20.59■□□□□ 0.89
HOXD8P13378 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
HOXD8P13378 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
HOXD8P13378 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
HOXD8P13378 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
HOXD8P13378 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
HOXD8P13378 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
HOXD8P13378 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
HOXD8P13378 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
HOXD8P13378 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
HOXD8P13378 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
HOXD8P13378 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
HOXD8P13378 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
HOXD8P13378 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
HOXD8P13378 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
HOXD8P13378 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
HOXD8P13378 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
HOXD8P13378 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
HOXD8P13378 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
HOXD8P13378 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
HOXD8P13378 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
HOXD8P13378 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
HOXD8P13378 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
HOXD8P13378 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
HOXD8P13378 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
HOXD8P13378 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
HOXD8P13378 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
HOXD8P13378 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
HOXD8P13378 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
HOXD8P13378 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
HOXD8P13378 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
HOXD8P13378 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
HOXD8P13378 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
HOXD8P13378 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
HOXD8P13378 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
HOXD8P13378 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
HOXD8P13378 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC20.57■□□□□ 0.88
HOXD8P13378 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
HOXD8P13378 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
HOXD8P13378 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
HOXD8P13378 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC20.57■□□□□ 0.88
HOXD8P13378 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
HOXD8P13378 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
HOXD8P13378 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
HOXD8P13378 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
HOXD8P13378 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
HOXD8P13378 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
HOXD8P13378 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
HOXD8P13378 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
HOXD8P13378 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
HOXD8P13378 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
HOXD8P13378 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
HOXD8P13378 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
HOXD8P13378 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
HOXD8P13378 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
HOXD8P13378 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
HOXD8P13378 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
HOXD8P13378 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
HOXD8P13378 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
HOXD8P13378 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
HOXD8P13378 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
HOXD8P13378 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
HOXD8P13378 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
HOXD8P13378 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
HOXD8P13378 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
HOXD8P13378 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
HOXD8P13378 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
HOXD8P13378 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
HOXD8P13378 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
HOXD8P13378 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
HOXD8P13378 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
HOXD8P13378 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
HOXD8P13378 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms