Protein–RNA interactions for Protein: P11388

TOP2A, DNA topoisomerase 2-alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,531 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP2AP11388 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
TOP2AP11388 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
TOP2AP11388 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
TOP2AP11388 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC32.65■■■□□ 2.82
TOP2AP11388 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC32.65■■■□□ 2.82
TOP2AP11388 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
TOP2AP11388 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC32.65■■■□□ 2.82
TOP2AP11388 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC32.65■■■□□ 2.82
TOP2AP11388 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
TOP2AP11388 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
TOP2AP11388 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.65■■■□□ 2.82
TOP2AP11388 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.82
TOP2AP11388 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC32.64■■■□□ 2.82
TOP2AP11388 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC32.64■■■□□ 2.82
TOP2AP11388 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.82
TOP2AP11388 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.82
TOP2AP11388 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.82
TOP2AP11388 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC32.64■■■□□ 2.82
TOP2AP11388 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.64■■■□□ 2.82
TOP2AP11388 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.64■■■□□ 2.82
TOP2AP11388 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC32.64■■■□□ 2.82
TOP2AP11388 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.82
TOP2AP11388 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
TOP2AP11388 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC32.63■■■□□ 2.81
TOP2AP11388 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC32.63■■■□□ 2.81
TOP2AP11388 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
TOP2AP11388 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
TOP2AP11388 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC32.63■■■□□ 2.81
TOP2AP11388 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
TOP2AP11388 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC32.62■■■□□ 2.81
TOP2AP11388 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
TOP2AP11388 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC32.62■■■□□ 2.81
TOP2AP11388 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC32.62■■■□□ 2.81
TOP2AP11388 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC32.62■■■□□ 2.81
TOP2AP11388 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC32.62■■■□□ 2.81
TOP2AP11388 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
TOP2AP11388 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
TOP2AP11388 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.62■■■□□ 2.81
TOP2AP11388 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
TOP2AP11388 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
TOP2AP11388 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC32.62■■■□□ 2.81
TOP2AP11388 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC32.61■■■□□ 2.81
TOP2AP11388 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.61■■■□□ 2.81
TOP2AP11388 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC32.61■■■□□ 2.81
TOP2AP11388 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC32.61■■■□□ 2.81
TOP2AP11388 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
TOP2AP11388 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC32.61■■■□□ 2.81
TOP2AP11388 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
TOP2AP11388 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
TOP2AP11388 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC32.61■■■□□ 2.81
TOP2AP11388 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC32.61■■■□□ 2.81
TOP2AP11388 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
TOP2AP11388 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
TOP2AP11388 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
TOP2AP11388 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC32.61■■■□□ 2.81
TOP2AP11388 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC32.61■■■□□ 2.81
TOP2AP11388 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC32.61■■■□□ 2.81
TOP2AP11388 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC32.61■■■□□ 2.81
TOP2AP11388 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
TOP2AP11388 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
TOP2AP11388 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC32.61■■■□□ 2.81
TOP2AP11388 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC32.61■■■□□ 2.81
TOP2AP11388 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
TOP2AP11388 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.61■■■□□ 2.81
TOP2AP11388 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
TOP2AP11388 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
TOP2AP11388 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
TOP2AP11388 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
TOP2AP11388 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
TOP2AP11388 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
TOP2AP11388 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
TOP2AP11388 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
TOP2AP11388 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
TOP2AP11388 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC32.6■■■□□ 2.81
TOP2AP11388 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
TOP2AP11388 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC32.6■■■□□ 2.81
TOP2AP11388 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC32.6■■■□□ 2.81
TOP2AP11388 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC32.6■■■□□ 2.81
TOP2AP11388 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
TOP2AP11388 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
TOP2AP11388 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
TOP2AP11388 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC32.59■■■□□ 2.81
TOP2AP11388 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC32.59■■■□□ 2.81
TOP2AP11388 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC32.59■■■□□ 2.81
TOP2AP11388 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
TOP2AP11388 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC32.59■■■□□ 2.81
TOP2AP11388 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC32.59■■■□□ 2.81
TOP2AP11388 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC32.59■■■□□ 2.81
TOP2AP11388 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC32.59■■■□□ 2.81
TOP2AP11388 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
TOP2AP11388 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.59■■■□□ 2.81
TOP2AP11388 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.59■■■□□ 2.81
TOP2AP11388 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
TOP2AP11388 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC32.59■■■□□ 2.81
TOP2AP11388 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC32.59■■■□□ 2.81
TOP2AP11388 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
TOP2AP11388 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.58■■■□□ 2.81
TOP2AP11388 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
TOP2AP11388 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.58■■■□□ 2.81
TOP2AP11388 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms