Protein–RNA interactions for Protein: O15078

CEP290, Centrosomal protein of 290 kDa, humanhuman

Predictions only

Length 2,479 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEP290O15078 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CEP290O15078 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CEP290O15078 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CEP290O15078 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
CEP290O15078 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CEP290O15078 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CEP290O15078 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CEP290O15078 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CEP290O15078 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CEP290O15078 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
CEP290O15078 ICAM2-205ENST00000578379 1064 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CEP290O15078 ICAM2-206ENST00000578892 1056 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CEP290O15078 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CEP290O15078 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CEP290O15078 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CEP290O15078 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CEP290O15078 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CEP290O15078 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CEP290O15078 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CEP290O15078 HLA-V-201ENST00000429037 534 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
CEP290O15078 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
CEP290O15078 PTGES3-205ENST00000456859 957 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CEP290O15078 DCUN1D5-209ENST00000531543 1030 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CEP290O15078 AC005225.4-201ENST00000557330 545 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
CEP290O15078 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CEP290O15078 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CEP290O15078 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CEP290O15078 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
CEP290O15078 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CEP290O15078 CRCP-205ENST00000431089 942 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CEP290O15078 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CEP290O15078 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CEP290O15078 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CEP290O15078 AL359644.1-202ENST00000637541 571 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CEP290O15078 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CEP290O15078 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CEP290O15078 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CEP290O15078 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
CEP290O15078 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
CEP290O15078 AC138304.1-201ENST00000563841 424 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CEP290O15078 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CEP290O15078 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CEP290O15078 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CEP290O15078 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CEP290O15078 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CEP290O15078 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CEP290O15078 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CEP290O15078 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CEP290O15078 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
CEP290O15078 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CEP290O15078 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
CEP290O15078 MEIS3P1-201ENST00000495167 958 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
CEP290O15078 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
CEP290O15078 AC087641.1-201ENST00000557561 1021 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
CEP290O15078 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CEP290O15078 INO80C-206ENST00000586489 594 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CEP290O15078 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CEP290O15078 CBR3-AS1-216ENST00000624883 564 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CEP290O15078 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CEP290O15078 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CEP290O15078 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CEP290O15078 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
CEP290O15078 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
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CEP290O15078 DHRS7-212ENST00000611054 1321 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CEP290O15078 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CEP290O15078 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CEP290O15078 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CEP290O15078 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CEP290O15078 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CEP290O15078 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CEP290O15078 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CEP290O15078 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CEP290O15078 AL022316.1-201ENST00000428765 572 ntTSL 4 BASIC20.17■□□□□ 0.82
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CEP290O15078 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
CEP290O15078 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CEP290O15078 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CEP290O15078 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CEP290O15078 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CEP290O15078 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CEP290O15078 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CEP290O15078 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
CEP290O15078 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CEP290O15078 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CEP290O15078 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CEP290O15078 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CEP290O15078 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
CEP290O15078 AC064807.1-203ENST00000520357 575 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CEP290O15078 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CEP290O15078 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CEP290O15078 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CEP290O15078 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CEP290O15078 AC026191.1-201ENST00000491930 829 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CEP290O15078 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CEP290O15078 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CEP290O15078 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CEP290O15078 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
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