Protein–RNA interactions for Protein: O14829

PPEF1, Serine/threonine-protein phosphatase with EF-hands 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 653 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPEF1O14829 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PPEF1O14829 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PPEF1O14829 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PPEF1O14829 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PPEF1O14829 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
PPEF1O14829 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PPEF1O14829 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PPEF1O14829 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PPEF1O14829 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PPEF1O14829 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PPEF1O14829 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PPEF1O14829 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PPEF1O14829 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PPEF1O14829 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PPEF1O14829 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
PPEF1O14829 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PPEF1O14829 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PPEF1O14829 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PPEF1O14829 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PPEF1O14829 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PPEF1O14829 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PPEF1O14829 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PPEF1O14829 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PPEF1O14829 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PPEF1O14829 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PPEF1O14829 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PPEF1O14829 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PPEF1O14829 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PPEF1O14829 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PPEF1O14829 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PPEF1O14829 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PPEF1O14829 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PPEF1O14829 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PPEF1O14829 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PPEF1O14829 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PPEF1O14829 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PPEF1O14829 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PPEF1O14829 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PPEF1O14829 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PPEF1O14829 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PPEF1O14829 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PPEF1O14829 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PPEF1O14829 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
PPEF1O14829 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PPEF1O14829 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
PPEF1O14829 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PPEF1O14829 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PPEF1O14829 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
PPEF1O14829 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PPEF1O14829 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PPEF1O14829 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
PPEF1O14829 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PPEF1O14829 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PPEF1O14829 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PPEF1O14829 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PPEF1O14829 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PPEF1O14829 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PPEF1O14829 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PPEF1O14829 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PPEF1O14829 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PPEF1O14829 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PPEF1O14829 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
PPEF1O14829 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PPEF1O14829 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PPEF1O14829 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
PPEF1O14829 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PPEF1O14829 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PPEF1O14829 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PPEF1O14829 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PPEF1O14829 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PPEF1O14829 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PPEF1O14829 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PPEF1O14829 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
PPEF1O14829 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PPEF1O14829 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PPEF1O14829 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PPEF1O14829 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PPEF1O14829 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PPEF1O14829 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
PPEF1O14829 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PPEF1O14829 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PPEF1O14829 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PPEF1O14829 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PPEF1O14829 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PPEF1O14829 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PPEF1O14829 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PPEF1O14829 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PPEF1O14829 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PPEF1O14829 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PPEF1O14829 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PPEF1O14829 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PPEF1O14829 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PPEF1O14829 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PPEF1O14829 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PPEF1O14829 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PPEF1O14829 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PPEF1O14829 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PPEF1O14829 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PPEF1O14829 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PPEF1O14829 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms