Protein–RNA interactions for Protein: A0A0U1RQF3

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,178 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A0A0U1RQF3 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
A0A0U1RQF3 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
A0A0U1RQF3 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
A0A0U1RQF3 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
A0A0U1RQF3 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
A0A0U1RQF3 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
A0A0U1RQF3 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
A0A0U1RQF3 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
A0A0U1RQF3 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
A0A0U1RQF3 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
A0A0U1RQF3 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
A0A0U1RQF3 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC20.08■□□□□ 0.81
A0A0U1RQF3 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
A0A0U1RQF3 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
A0A0U1RQF3 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
A0A0U1RQF3 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
A0A0U1RQF3 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
A0A0U1RQF3 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
A0A0U1RQF3 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
A0A0U1RQF3 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
A0A0U1RQF3 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
A0A0U1RQF3 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
A0A0U1RQF3 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
A0A0U1RQF3 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
A0A0U1RQF3 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
A0A0U1RQF3 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
A0A0U1RQF3 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
A0A0U1RQF3 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
A0A0U1RQF3 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
A0A0U1RQF3 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
A0A0U1RQF3 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC20.07■□□□□ 0.8
A0A0U1RQF3 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
A0A0U1RQF3 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
A0A0U1RQF3 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
A0A0U1RQF3 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
A0A0U1RQF3 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
A0A0U1RQF3 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
A0A0U1RQF3 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
A0A0U1RQF3 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
A0A0U1RQF3 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
A0A0U1RQF3 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
A0A0U1RQF3 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
A0A0U1RQF3 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
A0A0U1RQF3 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
A0A0U1RQF3 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
A0A0U1RQF3 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
A0A0U1RQF3 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
A0A0U1RQF3 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
A0A0U1RQF3 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
A0A0U1RQF3 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
A0A0U1RQF3 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
A0A0U1RQF3 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
A0A0U1RQF3 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
A0A0U1RQF3 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
A0A0U1RQF3 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
A0A0U1RQF3 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
A0A0U1RQF3 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
A0A0U1RQF3 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
A0A0U1RQF3 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
A0A0U1RQF3 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
A0A0U1RQF3 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
A0A0U1RQF3 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
A0A0U1RQF3 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
A0A0U1RQF3 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
A0A0U1RQF3 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
A0A0U1RQF3 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
A0A0U1RQF3 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
A0A0U1RQF3 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
A0A0U1RQF3 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
A0A0U1RQF3 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
A0A0U1RQF3 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
A0A0U1RQF3 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
A0A0U1RQF3 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
A0A0U1RQF3 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
A0A0U1RQF3 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
A0A0U1RQF3 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
A0A0U1RQF3 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
A0A0U1RQF3 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
A0A0U1RQF3 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
A0A0U1RQF3 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
A0A0U1RQF3 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
A0A0U1RQF3 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
A0A0U1RQF3 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
A0A0U1RQF3 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
A0A0U1RQF3 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
A0A0U1RQF3 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
A0A0U1RQF3 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
A0A0U1RQF3 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
A0A0U1RQF3 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
A0A0U1RQF3 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
A0A0U1RQF3 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
A0A0U1RQF3 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
A0A0U1RQF3 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
A0A0U1RQF3 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
A0A0U1RQF3 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
A0A0U1RQF3 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
A0A0U1RQF3 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
A0A0U1RQF3 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
A0A0U1RQF3 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
A0A0U1RQF3 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.6 ms