Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4B6

DCAF1, DDB1- and CUL4-associated factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,507 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DCAF1Q9Y4B6 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.76■■■■□ 3.31
DCAF1Q9Y4B6 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC35.75■■■■□ 3.31
DCAF1Q9Y4B6 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC35.75■■■■□ 3.31
DCAF1Q9Y4B6 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.75■■■■□ 3.31
DCAF1Q9Y4B6 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC35.75■■■■□ 3.31
DCAF1Q9Y4B6 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC35.75■■■■□ 3.31
DCAF1Q9Y4B6 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC35.75■■■■□ 3.31
DCAF1Q9Y4B6 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC35.75■■■■□ 3.31
DCAF1Q9Y4B6 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC35.75■■■■□ 3.31
DCAF1Q9Y4B6 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC35.75■■■■□ 3.31
DCAF1Q9Y4B6 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC35.75■■■■□ 3.31
DCAF1Q9Y4B6 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC35.75■■■■□ 3.31
DCAF1Q9Y4B6 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC35.75■■■■□ 3.31
DCAF1Q9Y4B6 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC35.75■■■■□ 3.31
DCAF1Q9Y4B6 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC35.75■■■■□ 3.31
DCAF1Q9Y4B6 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.75■■■■□ 3.31
DCAF1Q9Y4B6 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.75■■■■□ 3.31
DCAF1Q9Y4B6 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC35.75■■■■□ 3.31
DCAF1Q9Y4B6 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.75■■■■□ 3.31
DCAF1Q9Y4B6 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.75■■■■□ 3.31
DCAF1Q9Y4B6 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC35.75■■■■□ 3.31
DCAF1Q9Y4B6 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.75■■■■□ 3.31
DCAF1Q9Y4B6 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC35.74■■■■□ 3.31
DCAF1Q9Y4B6 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC35.74■■■■□ 3.31
DCAF1Q9Y4B6 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.74■■■■□ 3.31
DCAF1Q9Y4B6 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.74■■■■□ 3.31
DCAF1Q9Y4B6 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.74■■■■□ 3.31
DCAF1Q9Y4B6 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.74■■■■□ 3.31
DCAF1Q9Y4B6 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.74■■■■□ 3.31
DCAF1Q9Y4B6 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.74■■■■□ 3.31
DCAF1Q9Y4B6 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.73■■■■□ 3.31
DCAF1Q9Y4B6 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC35.73■■■■□ 3.31
DCAF1Q9Y4B6 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC35.73■■■■□ 3.31
DCAF1Q9Y4B6 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC35.73■■■■□ 3.31
DCAF1Q9Y4B6 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC35.73■■■■□ 3.31
DCAF1Q9Y4B6 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC35.73■■■■□ 3.31
DCAF1Q9Y4B6 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC35.73■■■■□ 3.31
DCAF1Q9Y4B6 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.73■■■■□ 3.31
DCAF1Q9Y4B6 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.73■■■■□ 3.31
DCAF1Q9Y4B6 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.73■■■■□ 3.31
DCAF1Q9Y4B6 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC35.73■■■■□ 3.31
DCAF1Q9Y4B6 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC35.73■■■■□ 3.31
DCAF1Q9Y4B6 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC35.73■■■■□ 3.31
DCAF1Q9Y4B6 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC35.73■■■■□ 3.31
DCAF1Q9Y4B6 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC35.73■■■■□ 3.31
DCAF1Q9Y4B6 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC35.73■■■■□ 3.31
DCAF1Q9Y4B6 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC35.73■■■■□ 3.31
DCAF1Q9Y4B6 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC35.72■■■■□ 3.31
DCAF1Q9Y4B6 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC35.72■■■■□ 3.31
DCAF1Q9Y4B6 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.72■■■■□ 3.31
DCAF1Q9Y4B6 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.72■■■■□ 3.31
DCAF1Q9Y4B6 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC35.72■■■■□ 3.31
DCAF1Q9Y4B6 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.72■■■■□ 3.31
DCAF1Q9Y4B6 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.72■■■■□ 3.31
DCAF1Q9Y4B6 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.72■■■■□ 3.31
DCAF1Q9Y4B6 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC35.72■■■■□ 3.31
DCAF1Q9Y4B6 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.72■■■■□ 3.31
DCAF1Q9Y4B6 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC35.72■■■■□ 3.31
DCAF1Q9Y4B6 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC35.72■■■■□ 3.31
DCAF1Q9Y4B6 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC35.72■■■■□ 3.31
DCAF1Q9Y4B6 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.72■■■■□ 3.31
DCAF1Q9Y4B6 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC35.72■■■■□ 3.31
DCAF1Q9Y4B6 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.72■■■■□ 3.31
DCAF1Q9Y4B6 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC35.72■■■■□ 3.31
DCAF1Q9Y4B6 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC35.72■■■■□ 3.31
DCAF1Q9Y4B6 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.72■■■■□ 3.31
DCAF1Q9Y4B6 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC35.72■■■■□ 3.31
DCAF1Q9Y4B6 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC35.72■■■■□ 3.31
DCAF1Q9Y4B6 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.72■■■■□ 3.31
DCAF1Q9Y4B6 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC35.72■■■■□ 3.31
DCAF1Q9Y4B6 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.71■■■■□ 3.31
DCAF1Q9Y4B6 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC35.71■■■■□ 3.31
DCAF1Q9Y4B6 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.71■■■■□ 3.31
DCAF1Q9Y4B6 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC35.71■■■■□ 3.31
DCAF1Q9Y4B6 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC35.71■■■■□ 3.31
DCAF1Q9Y4B6 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.71■■■■□ 3.31
DCAF1Q9Y4B6 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC35.71■■■■□ 3.31
DCAF1Q9Y4B6 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.71■■■■□ 3.31
DCAF1Q9Y4B6 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC35.71■■■■□ 3.31
DCAF1Q9Y4B6 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC35.71■■■■□ 3.31
DCAF1Q9Y4B6 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC35.71■■■■□ 3.31
DCAF1Q9Y4B6 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.71■■■■□ 3.31
DCAF1Q9Y4B6 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.71■■■■□ 3.31
DCAF1Q9Y4B6 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC35.71■■■■□ 3.31
DCAF1Q9Y4B6 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.7■■■■□ 3.31
DCAF1Q9Y4B6 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.7■■■■□ 3.31
DCAF1Q9Y4B6 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.7■■■■□ 3.31
DCAF1Q9Y4B6 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC35.7■■■■□ 3.31
DCAF1Q9Y4B6 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC35.7■■■■□ 3.31
DCAF1Q9Y4B6 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.7■■■■□ 3.31
DCAF1Q9Y4B6 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.7■■■■□ 3.31
DCAF1Q9Y4B6 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.7■■■■□ 3.31
DCAF1Q9Y4B6 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.7■■■■□ 3.31
DCAF1Q9Y4B6 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.7■■■■□ 3.31
DCAF1Q9Y4B6 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.7■■■■□ 3.31
DCAF1Q9Y4B6 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC35.7■■■■□ 3.31
DCAF1Q9Y4B6 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.7■■■■□ 3.31
DCAF1Q9Y4B6 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC35.7■■■■□ 3.31
DCAF1Q9Y4B6 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC35.7■■■■□ 3.31
DCAF1Q9Y4B6 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC35.7■■■■□ 3.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.4 ms