Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2L5

TRAPPC8, Trafficking protein particle complex subunit 8, humanhuman

Predictions only

Length 1,435 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC8Q9Y2L5 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC27.96■■■□□ 2.07
TRAPPC8Q9Y2L5 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
TRAPPC8Q9Y2L5 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
TRAPPC8Q9Y2L5 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
TRAPPC8Q9Y2L5 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
TRAPPC8Q9Y2L5 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
TRAPPC8Q9Y2L5 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
TRAPPC8Q9Y2L5 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC27.96■■■□□ 2.07
TRAPPC8Q9Y2L5 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
TRAPPC8Q9Y2L5 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
TRAPPC8Q9Y2L5 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
TRAPPC8Q9Y2L5 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC27.95■■■□□ 2.07
TRAPPC8Q9Y2L5 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
TRAPPC8Q9Y2L5 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.07
TRAPPC8Q9Y2L5 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC27.95■■■□□ 2.07
TRAPPC8Q9Y2L5 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC27.95■■■□□ 2.07
TRAPPC8Q9Y2L5 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.07
TRAPPC8Q9Y2L5 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC27.95■■■□□ 2.07
TRAPPC8Q9Y2L5 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.07
TRAPPC8Q9Y2L5 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC27.95■■■□□ 2.07
TRAPPC8Q9Y2L5 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.07
TRAPPC8Q9Y2L5 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
TRAPPC8Q9Y2L5 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.07
TRAPPC8Q9Y2L5 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
TRAPPC8Q9Y2L5 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
TRAPPC8Q9Y2L5 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
TRAPPC8Q9Y2L5 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
TRAPPC8Q9Y2L5 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
TRAPPC8Q9Y2L5 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
TRAPPC8Q9Y2L5 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
TRAPPC8Q9Y2L5 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
TRAPPC8Q9Y2L5 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
TRAPPC8Q9Y2L5 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
TRAPPC8Q9Y2L5 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
TRAPPC8Q9Y2L5 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
TRAPPC8Q9Y2L5 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
TRAPPC8Q9Y2L5 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
TRAPPC8Q9Y2L5 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
TRAPPC8Q9Y2L5 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
TRAPPC8Q9Y2L5 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC27.94■■■□□ 2.06
TRAPPC8Q9Y2L5 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
TRAPPC8Q9Y2L5 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC27.94■■■□□ 2.06
TRAPPC8Q9Y2L5 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
TRAPPC8Q9Y2L5 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC27.94■■■□□ 2.06
TRAPPC8Q9Y2L5 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
TRAPPC8Q9Y2L5 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
TRAPPC8Q9Y2L5 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
TRAPPC8Q9Y2L5 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
TRAPPC8Q9Y2L5 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
TRAPPC8Q9Y2L5 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
TRAPPC8Q9Y2L5 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
TRAPPC8Q9Y2L5 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
TRAPPC8Q9Y2L5 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
TRAPPC8Q9Y2L5 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
TRAPPC8Q9Y2L5 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
TRAPPC8Q9Y2L5 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
TRAPPC8Q9Y2L5 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
TRAPPC8Q9Y2L5 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
TRAPPC8Q9Y2L5 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC27.93■■■□□ 2.06
TRAPPC8Q9Y2L5 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.93■■■□□ 2.06
TRAPPC8Q9Y2L5 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
TRAPPC8Q9Y2L5 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
TRAPPC8Q9Y2L5 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
TRAPPC8Q9Y2L5 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
TRAPPC8Q9Y2L5 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC27.93■■■□□ 2.06
TRAPPC8Q9Y2L5 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
TRAPPC8Q9Y2L5 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
TRAPPC8Q9Y2L5 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
TRAPPC8Q9Y2L5 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
TRAPPC8Q9Y2L5 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
TRAPPC8Q9Y2L5 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
TRAPPC8Q9Y2L5 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
TRAPPC8Q9Y2L5 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
TRAPPC8Q9Y2L5 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
TRAPPC8Q9Y2L5 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
TRAPPC8Q9Y2L5 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
TRAPPC8Q9Y2L5 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
TRAPPC8Q9Y2L5 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
TRAPPC8Q9Y2L5 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
TRAPPC8Q9Y2L5 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
TRAPPC8Q9Y2L5 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
TRAPPC8Q9Y2L5 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
TRAPPC8Q9Y2L5 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
TRAPPC8Q9Y2L5 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
TRAPPC8Q9Y2L5 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
TRAPPC8Q9Y2L5 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
TRAPPC8Q9Y2L5 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
TRAPPC8Q9Y2L5 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
TRAPPC8Q9Y2L5 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
TRAPPC8Q9Y2L5 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
TRAPPC8Q9Y2L5 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
TRAPPC8Q9Y2L5 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
TRAPPC8Q9Y2L5 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
TRAPPC8Q9Y2L5 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
TRAPPC8Q9Y2L5 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
TRAPPC8Q9Y2L5 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
TRAPPC8Q9Y2L5 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
TRAPPC8Q9Y2L5 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
TRAPPC8Q9Y2L5 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
TRAPPC8Q9Y2L5 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.5 ms