Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2G9

SBNO2, Protein strawberry notch homolog 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,366 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SBNO2Q9Y2G9 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
SBNO2Q9Y2G9 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SBNO2Q9Y2G9 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SBNO2Q9Y2G9 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
SBNO2Q9Y2G9 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
SBNO2Q9Y2G9 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SBNO2Q9Y2G9 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
SBNO2Q9Y2G9 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
SBNO2Q9Y2G9 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
SBNO2Q9Y2G9 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
SBNO2Q9Y2G9 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
SBNO2Q9Y2G9 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SBNO2Q9Y2G9 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
SBNO2Q9Y2G9 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
SBNO2Q9Y2G9 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
SBNO2Q9Y2G9 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
SBNO2Q9Y2G9 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SBNO2Q9Y2G9 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SBNO2Q9Y2G9 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SBNO2Q9Y2G9 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SBNO2Q9Y2G9 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SBNO2Q9Y2G9 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
SBNO2Q9Y2G9 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
SBNO2Q9Y2G9 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC25.75■■□□□ 1.71
SBNO2Q9Y2G9 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SBNO2Q9Y2G9 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SBNO2Q9Y2G9 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SBNO2Q9Y2G9 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SBNO2Q9Y2G9 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SBNO2Q9Y2G9 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SBNO2Q9Y2G9 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SBNO2Q9Y2G9 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
SBNO2Q9Y2G9 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SBNO2Q9Y2G9 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
SBNO2Q9Y2G9 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SBNO2Q9Y2G9 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
SBNO2Q9Y2G9 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SBNO2Q9Y2G9 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SBNO2Q9Y2G9 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
SBNO2Q9Y2G9 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
SBNO2Q9Y2G9 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
SBNO2Q9Y2G9 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SBNO2Q9Y2G9 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SBNO2Q9Y2G9 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SBNO2Q9Y2G9 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SBNO2Q9Y2G9 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
SBNO2Q9Y2G9 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SBNO2Q9Y2G9 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SBNO2Q9Y2G9 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SBNO2Q9Y2G9 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SBNO2Q9Y2G9 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SBNO2Q9Y2G9 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SBNO2Q9Y2G9 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SBNO2Q9Y2G9 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
SBNO2Q9Y2G9 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
SBNO2Q9Y2G9 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SBNO2Q9Y2G9 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SBNO2Q9Y2G9 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SBNO2Q9Y2G9 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SBNO2Q9Y2G9 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SBNO2Q9Y2G9 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SBNO2Q9Y2G9 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SBNO2Q9Y2G9 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SBNO2Q9Y2G9 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SBNO2Q9Y2G9 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SBNO2Q9Y2G9 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SBNO2Q9Y2G9 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SBNO2Q9Y2G9 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SBNO2Q9Y2G9 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SBNO2Q9Y2G9 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SBNO2Q9Y2G9 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SBNO2Q9Y2G9 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SBNO2Q9Y2G9 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SBNO2Q9Y2G9 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SBNO2Q9Y2G9 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
SBNO2Q9Y2G9 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SBNO2Q9Y2G9 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SBNO2Q9Y2G9 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SBNO2Q9Y2G9 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
SBNO2Q9Y2G9 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
SBNO2Q9Y2G9 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
SBNO2Q9Y2G9 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SBNO2Q9Y2G9 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
SBNO2Q9Y2G9 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
SBNO2Q9Y2G9 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SBNO2Q9Y2G9 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SBNO2Q9Y2G9 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SBNO2Q9Y2G9 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SBNO2Q9Y2G9 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SBNO2Q9Y2G9 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SBNO2Q9Y2G9 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
SBNO2Q9Y2G9 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
SBNO2Q9Y2G9 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
SBNO2Q9Y2G9 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
SBNO2Q9Y2G9 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
SBNO2Q9Y2G9 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
SBNO2Q9Y2G9 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SBNO2Q9Y2G9 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SBNO2Q9Y2G9 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
SBNO2Q9Y2G9 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.3 ms