Protein–RNA interactions for Protein: Q9UII2

ATPIF1, ATPase inhibitor, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 106 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATPIF1Q9UII2 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
ATPIF1Q9UII2 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ATPIF1Q9UII2 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ATPIF1Q9UII2 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ATPIF1Q9UII2 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ATPIF1Q9UII2 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ATPIF1Q9UII2 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ATPIF1Q9UII2 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ATPIF1Q9UII2 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
ATPIF1Q9UII2 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ATPIF1Q9UII2 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ATPIF1Q9UII2 XKR7-201ENST00000562532 7844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ATPIF1Q9UII2 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ATPIF1Q9UII2 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ATPIF1Q9UII2 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ATPIF1Q9UII2 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
ATPIF1Q9UII2 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
ATPIF1Q9UII2 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
ATPIF1Q9UII2 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
ATPIF1Q9UII2 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
ATPIF1Q9UII2 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ATPIF1Q9UII2 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ATPIF1Q9UII2 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ATPIF1Q9UII2 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
ATPIF1Q9UII2 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
ATPIF1Q9UII2 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
ATPIF1Q9UII2 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ATPIF1Q9UII2 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ATPIF1Q9UII2 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
ATPIF1Q9UII2 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ATPIF1Q9UII2 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ATPIF1Q9UII2 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ATPIF1Q9UII2 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
ATPIF1Q9UII2 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ATPIF1Q9UII2 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ATPIF1Q9UII2 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ATPIF1Q9UII2 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ATPIF1Q9UII2 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ATPIF1Q9UII2 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ATPIF1Q9UII2 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ATPIF1Q9UII2 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ATPIF1Q9UII2 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ATPIF1Q9UII2 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ATPIF1Q9UII2 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ATPIF1Q9UII2 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ATPIF1Q9UII2 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ATPIF1Q9UII2 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ATPIF1Q9UII2 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ATPIF1Q9UII2 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ATPIF1Q9UII2 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ATPIF1Q9UII2 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ATPIF1Q9UII2 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ATPIF1Q9UII2 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ATPIF1Q9UII2 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ATPIF1Q9UII2 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ATPIF1Q9UII2 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ATPIF1Q9UII2 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ATPIF1Q9UII2 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ATPIF1Q9UII2 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
ATPIF1Q9UII2 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ATPIF1Q9UII2 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ATPIF1Q9UII2 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
ATPIF1Q9UII2 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ATPIF1Q9UII2 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ATPIF1Q9UII2 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ATPIF1Q9UII2 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ATPIF1Q9UII2 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
ATPIF1Q9UII2 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
ATPIF1Q9UII2 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ATPIF1Q9UII2 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ATPIF1Q9UII2 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ATPIF1Q9UII2 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ATPIF1Q9UII2 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ATPIF1Q9UII2 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ATPIF1Q9UII2 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ATPIF1Q9UII2 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ATPIF1Q9UII2 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ATPIF1Q9UII2 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ATPIF1Q9UII2 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ATPIF1Q9UII2 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ATPIF1Q9UII2 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ATPIF1Q9UII2 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ATPIF1Q9UII2 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ATPIF1Q9UII2 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
ATPIF1Q9UII2 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ATPIF1Q9UII2 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ATPIF1Q9UII2 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ATPIF1Q9UII2 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ATPIF1Q9UII2 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ATPIF1Q9UII2 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ATPIF1Q9UII2 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ATPIF1Q9UII2 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ATPIF1Q9UII2 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ATPIF1Q9UII2 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ATPIF1Q9UII2 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ATPIF1Q9UII2 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
ATPIF1Q9UII2 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ATPIF1Q9UII2 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ATPIF1Q9UII2 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ATPIF1Q9UII2 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.8 ms