Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBF6

RNF7, RING-box protein 2, humanhuman

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Length 113 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF7Q9UBF6 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RNF7Q9UBF6 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RNF7Q9UBF6 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RNF7Q9UBF6 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RNF7Q9UBF6 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
RNF7Q9UBF6 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RNF7Q9UBF6 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RNF7Q9UBF6 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RNF7Q9UBF6 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RNF7Q9UBF6 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RNF7Q9UBF6 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RNF7Q9UBF6 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RNF7Q9UBF6 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RNF7Q9UBF6 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RNF7Q9UBF6 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RNF7Q9UBF6 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RNF7Q9UBF6 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RNF7Q9UBF6 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RNF7Q9UBF6 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RNF7Q9UBF6 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RNF7Q9UBF6 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RNF7Q9UBF6 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RNF7Q9UBF6 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RNF7Q9UBF6 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RNF7Q9UBF6 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RNF7Q9UBF6 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RNF7Q9UBF6 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
RNF7Q9UBF6 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RNF7Q9UBF6 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RNF7Q9UBF6 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RNF7Q9UBF6 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
RNF7Q9UBF6 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RNF7Q9UBF6 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
RNF7Q9UBF6 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
RNF7Q9UBF6 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
RNF7Q9UBF6 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
RNF7Q9UBF6 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
RNF7Q9UBF6 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
RNF7Q9UBF6 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
RNF7Q9UBF6 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
RNF7Q9UBF6 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
RNF7Q9UBF6 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
RNF7Q9UBF6 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
RNF7Q9UBF6 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.11
RNF7Q9UBF6 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
RNF7Q9UBF6 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
RNF7Q9UBF6 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
RNF7Q9UBF6 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
RNF7Q9UBF6 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
RNF7Q9UBF6 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RNF7Q9UBF6 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RNF7Q9UBF6 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RNF7Q9UBF6 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RNF7Q9UBF6 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RNF7Q9UBF6 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RNF7Q9UBF6 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RNF7Q9UBF6 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RNF7Q9UBF6 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RNF7Q9UBF6 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
RNF7Q9UBF6 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RNF7Q9UBF6 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RNF7Q9UBF6 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
RNF7Q9UBF6 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RNF7Q9UBF6 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RNF7Q9UBF6 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RNF7Q9UBF6 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RNF7Q9UBF6 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RNF7Q9UBF6 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RNF7Q9UBF6 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RNF7Q9UBF6 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RNF7Q9UBF6 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
RNF7Q9UBF6 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RNF7Q9UBF6 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RNF7Q9UBF6 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RNF7Q9UBF6 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RNF7Q9UBF6 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RNF7Q9UBF6 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RNF7Q9UBF6 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RNF7Q9UBF6 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RNF7Q9UBF6 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RNF7Q9UBF6 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RNF7Q9UBF6 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RNF7Q9UBF6 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RNF7Q9UBF6 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
RNF7Q9UBF6 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RNF7Q9UBF6 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RNF7Q9UBF6 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RNF7Q9UBF6 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RNF7Q9UBF6 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RNF7Q9UBF6 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
RNF7Q9UBF6 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RNF7Q9UBF6 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RNF7Q9UBF6 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RNF7Q9UBF6 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RNF7Q9UBF6 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RNF7Q9UBF6 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RNF7Q9UBF6 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RNF7Q9UBF6 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RNF7Q9UBF6 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
RNF7Q9UBF6 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
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