Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRR1

CYTL1, Cytokine-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 136 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYTL1Q9NRR1 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC15.07■□□□□ 0
CYTL1Q9NRR1 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC15.07■□□□□ 0
CYTL1Q9NRR1 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CYTL1Q9NRR1 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CYTL1Q9NRR1 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CYTL1Q9NRR1 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CYTL1Q9NRR1 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC15.06■□□□□ 0
CYTL1Q9NRR1 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CYTL1Q9NRR1 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
CYTL1Q9NRR1 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CYTL1Q9NRR1 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
CYTL1Q9NRR1 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CYTL1Q9NRR1 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CYTL1Q9NRR1 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC15.06■□□□□ 0
CYTL1Q9NRR1 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CYTL1Q9NRR1 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CYTL1Q9NRR1 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CYTL1Q9NRR1 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
CYTL1Q9NRR1 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC15.06■□□□□ 0
CYTL1Q9NRR1 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CYTL1Q9NRR1 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CYTL1Q9NRR1 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CYTL1Q9NRR1 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CYTL1Q9NRR1 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CYTL1Q9NRR1 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CYTL1Q9NRR1 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CYTL1Q9NRR1 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC15.06■□□□□ 0
CYTL1Q9NRR1 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CYTL1Q9NRR1 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CYTL1Q9NRR1 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CYTL1Q9NRR1 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CYTL1Q9NRR1 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CYTL1Q9NRR1 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CYTL1Q9NRR1 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
CYTL1Q9NRR1 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC15.06■□□□□ 0
CYTL1Q9NRR1 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CYTL1Q9NRR1 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CYTL1Q9NRR1 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CYTL1Q9NRR1 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CYTL1Q9NRR1 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CYTL1Q9NRR1 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
CYTL1Q9NRR1 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CYTL1Q9NRR1 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CYTL1Q9NRR1 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CYTL1Q9NRR1 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CYTL1Q9NRR1 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CYTL1Q9NRR1 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
CYTL1Q9NRR1 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CYTL1Q9NRR1 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CYTL1Q9NRR1 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
CYTL1Q9NRR1 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CYTL1Q9NRR1 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CYTL1Q9NRR1 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
CYTL1Q9NRR1 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CYTL1Q9NRR1 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CYTL1Q9NRR1 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
CYTL1Q9NRR1 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
CYTL1Q9NRR1 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CYTL1Q9NRR1 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
CYTL1Q9NRR1 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CYTL1Q9NRR1 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
CYTL1Q9NRR1 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
CYTL1Q9NRR1 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CYTL1Q9NRR1 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CYTL1Q9NRR1 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
CYTL1Q9NRR1 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CYTL1Q9NRR1 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CYTL1Q9NRR1 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CYTL1Q9NRR1 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
CYTL1Q9NRR1 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CYTL1Q9NRR1 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CYTL1Q9NRR1 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CYTL1Q9NRR1 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CYTL1Q9NRR1 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
CYTL1Q9NRR1 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CYTL1Q9NRR1 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CYTL1Q9NRR1 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CYTL1Q9NRR1 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CYTL1Q9NRR1 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CYTL1Q9NRR1 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CYTL1Q9NRR1 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CYTL1Q9NRR1 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CYTL1Q9NRR1 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC15.04■□□□□ -0
CYTL1Q9NRR1 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CYTL1Q9NRR1 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CYTL1Q9NRR1 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CYTL1Q9NRR1 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
CYTL1Q9NRR1 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CYTL1Q9NRR1 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CYTL1Q9NRR1 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CYTL1Q9NRR1 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CYTL1Q9NRR1 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CYTL1Q9NRR1 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CYTL1Q9NRR1 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
CYTL1Q9NRR1 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CYTL1Q9NRR1 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CYTL1Q9NRR1 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CYTL1Q9NRR1 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CYTL1Q9NRR1 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CYTL1Q9NRR1 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.8 ms