Protein–RNA interactions for Protein: Q9H4L4

SENP3, Sentrin-specific protease 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 574 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SENP3Q9H4L4 AC068196.1-201ENST00000456895 833 ntTSL 3 BASIC27.61■■■□□ 2.01
SENP3Q9H4L4 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
SENP3Q9H4L4 LINC02428-201ENST00000508099 527 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
SENP3Q9H4L4 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
SENP3Q9H4L4 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
SENP3Q9H4L4 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
SENP3Q9H4L4 ATF7-204ENST00000548118 774 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
SENP3Q9H4L4 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
SENP3Q9H4L4 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
SENP3Q9H4L4 ATF7-212ENST00000591397 860 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
SENP3Q9H4L4 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
SENP3Q9H4L4 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
SENP3Q9H4L4 AC091057.2-201ENST00000602594 792 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
SENP3Q9H4L4 AC068790.2-201ENST00000602601 557 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
SENP3Q9H4L4 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
SENP3Q9H4L4 AC007527.2-201ENST00000621825 546 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
SENP3Q9H4L4 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
SENP3Q9H4L4 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
SENP3Q9H4L4 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC27.61■■■□□ 2.01
SENP3Q9H4L4 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
SENP3Q9H4L4 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC27.61■■■□□ 2.01
SENP3Q9H4L4 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
SENP3Q9H4L4 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
SENP3Q9H4L4 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
SENP3Q9H4L4 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
SENP3Q9H4L4 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
SENP3Q9H4L4 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
SENP3Q9H4L4 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
SENP3Q9H4L4 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
SENP3Q9H4L4 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
SENP3Q9H4L4 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
SENP3Q9H4L4 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
SENP3Q9H4L4 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
SENP3Q9H4L4 AC011997.1-201ENST00000409845 1032 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
SENP3Q9H4L4 AL162253.1-201ENST00000443792 758 ntTSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
SENP3Q9H4L4 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
SENP3Q9H4L4 LINC01861-201ENST00000509568 537 ntTSL 4 BASIC27.6■■■□□ 2.01
SENP3Q9H4L4 AC025917.1-202ENST00000566344 635 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
SENP3Q9H4L4 BNIP3P40-201ENST00000596017 556 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
SENP3Q9H4L4 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
SENP3Q9H4L4 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
SENP3Q9H4L4 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
SENP3Q9H4L4 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
SENP3Q9H4L4 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
SENP3Q9H4L4 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
SENP3Q9H4L4 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
SENP3Q9H4L4 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
SENP3Q9H4L4 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC27.6■■■□□ 2.01
SENP3Q9H4L4 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
SENP3Q9H4L4 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
SENP3Q9H4L4 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
SENP3Q9H4L4 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
SENP3Q9H4L4 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
SENP3Q9H4L4 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
SENP3Q9H4L4 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
SENP3Q9H4L4 AC008549.2-201ENST00000333482 706 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
SENP3Q9H4L4 LINC01098-201ENST00000507870 1034 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
SENP3Q9H4L4 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
SENP3Q9H4L4 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
SENP3Q9H4L4 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
SENP3Q9H4L4 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
SENP3Q9H4L4 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
SENP3Q9H4L4 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
SENP3Q9H4L4 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
SENP3Q9H4L4 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
SENP3Q9H4L4 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
SENP3Q9H4L4 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
SENP3Q9H4L4 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
SENP3Q9H4L4 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
SENP3Q9H4L4 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
SENP3Q9H4L4 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
SENP3Q9H4L4 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
SENP3Q9H4L4 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
SENP3Q9H4L4 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
SENP3Q9H4L4 LINC01715-201ENST00000420776 624 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
SENP3Q9H4L4 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
SENP3Q9H4L4 BX005214.2-201ENST00000423499 1077 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
SENP3Q9H4L4 LINC02505-203ENST00000515128 756 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
SENP3Q9H4L4 LINC02410-201ENST00000553095 393 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
SENP3Q9H4L4 AC087683.2-201ENST00000611384 326 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
SENP3Q9H4L4 AL353770.4-202ENST00000621296 1126 ntTSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
SENP3Q9H4L4 BX005040.1-201ENST00000622281 1126 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
SENP3Q9H4L4 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
SENP3Q9H4L4 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
SENP3Q9H4L4 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
SENP3Q9H4L4 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
SENP3Q9H4L4 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
SENP3Q9H4L4 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
SENP3Q9H4L4 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
SENP3Q9H4L4 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
SENP3Q9H4L4 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC27.57■■■□□ 2
SENP3Q9H4L4 ATP6AP2-204ENST00000447485 1254 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
SENP3Q9H4L4 AL355314.1-201ENST00000453639 316 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
SENP3Q9H4L4 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC27.57■■■□□ 2
SENP3Q9H4L4 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
SENP3Q9H4L4 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
SENP3Q9H4L4 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
SENP3Q9H4L4 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
SENP3Q9H4L4 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
SENP3Q9H4L4 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.6 ms