Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYB0

SHANK3, SH3 and multiple ankyrin repeat domains protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,731 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHANK3Q9BYB0 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SHANK3Q9BYB0 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SHANK3Q9BYB0 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SHANK3Q9BYB0 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SHANK3Q9BYB0 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SHANK3Q9BYB0 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SHANK3Q9BYB0 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SHANK3Q9BYB0 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SHANK3Q9BYB0 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SHANK3Q9BYB0 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SHANK3Q9BYB0 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SHANK3Q9BYB0 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SHANK3Q9BYB0 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SHANK3Q9BYB0 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SHANK3Q9BYB0 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SHANK3Q9BYB0 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SHANK3Q9BYB0 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SHANK3Q9BYB0 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SHANK3Q9BYB0 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
SHANK3Q9BYB0 LINC02084-201ENST00000606069 1096 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
SHANK3Q9BYB0 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SHANK3Q9BYB0 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
SHANK3Q9BYB0 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SHANK3Q9BYB0 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SHANK3Q9BYB0 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SHANK3Q9BYB0 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SHANK3Q9BYB0 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SHANK3Q9BYB0 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SHANK3Q9BYB0 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SHANK3Q9BYB0 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SHANK3Q9BYB0 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
SHANK3Q9BYB0 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
SHANK3Q9BYB0 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SHANK3Q9BYB0 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SHANK3Q9BYB0 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SHANK3Q9BYB0 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SHANK3Q9BYB0 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SHANK3Q9BYB0 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SHANK3Q9BYB0 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SHANK3Q9BYB0 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SHANK3Q9BYB0 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SHANK3Q9BYB0 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
SHANK3Q9BYB0 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SHANK3Q9BYB0 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
SHANK3Q9BYB0 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SHANK3Q9BYB0 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SHANK3Q9BYB0 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
SHANK3Q9BYB0 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
SHANK3Q9BYB0 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SHANK3Q9BYB0 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SHANK3Q9BYB0 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SHANK3Q9BYB0 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SHANK3Q9BYB0 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SHANK3Q9BYB0 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SHANK3Q9BYB0 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SHANK3Q9BYB0 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SHANK3Q9BYB0 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SHANK3Q9BYB0 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SHANK3Q9BYB0 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SHANK3Q9BYB0 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SHANK3Q9BYB0 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SHANK3Q9BYB0 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SHANK3Q9BYB0 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
SHANK3Q9BYB0 AL391069.3-201ENST00000455503 618 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SHANK3Q9BYB0 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SHANK3Q9BYB0 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SHANK3Q9BYB0 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SHANK3Q9BYB0 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SHANK3Q9BYB0 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SHANK3Q9BYB0 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
SHANK3Q9BYB0 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SHANK3Q9BYB0 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SHANK3Q9BYB0 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SHANK3Q9BYB0 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SHANK3Q9BYB0 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SHANK3Q9BYB0 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SHANK3Q9BYB0 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SHANK3Q9BYB0 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SHANK3Q9BYB0 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
SHANK3Q9BYB0 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SHANK3Q9BYB0 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SHANK3Q9BYB0 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SHANK3Q9BYB0 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SHANK3Q9BYB0 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SHANK3Q9BYB0 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SHANK3Q9BYB0 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SHANK3Q9BYB0 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SHANK3Q9BYB0 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SHANK3Q9BYB0 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SHANK3Q9BYB0 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SHANK3Q9BYB0 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SHANK3Q9BYB0 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SHANK3Q9BYB0 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SHANK3Q9BYB0 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SHANK3Q9BYB0 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SHANK3Q9BYB0 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SHANK3Q9BYB0 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SHANK3Q9BYB0 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SHANK3Q9BYB0 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SHANK3Q9BYB0 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23 ms