Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXT8

RNF17, RING finger protein 17, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,623 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF17Q9BXT8 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC27.37■■□□□ 1.97
RNF17Q9BXT8 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
RNF17Q9BXT8 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
RNF17Q9BXT8 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
RNF17Q9BXT8 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
RNF17Q9BXT8 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
RNF17Q9BXT8 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
RNF17Q9BXT8 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
RNF17Q9BXT8 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
RNF17Q9BXT8 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
RNF17Q9BXT8 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
RNF17Q9BXT8 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
RNF17Q9BXT8 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
RNF17Q9BXT8 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
RNF17Q9BXT8 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
RNF17Q9BXT8 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
RNF17Q9BXT8 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
RNF17Q9BXT8 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
RNF17Q9BXT8 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
RNF17Q9BXT8 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
RNF17Q9BXT8 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
RNF17Q9BXT8 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
RNF17Q9BXT8 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
RNF17Q9BXT8 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
RNF17Q9BXT8 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
RNF17Q9BXT8 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
RNF17Q9BXT8 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC27.35■■□□□ 1.97
RNF17Q9BXT8 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC27.35■■□□□ 1.97
RNF17Q9BXT8 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
RNF17Q9BXT8 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
RNF17Q9BXT8 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
RNF17Q9BXT8 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
RNF17Q9BXT8 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
RNF17Q9BXT8 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
RNF17Q9BXT8 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
RNF17Q9BXT8 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
RNF17Q9BXT8 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
RNF17Q9BXT8 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
RNF17Q9BXT8 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
RNF17Q9BXT8 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
RNF17Q9BXT8 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
RNF17Q9BXT8 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
RNF17Q9BXT8 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
RNF17Q9BXT8 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
RNF17Q9BXT8 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
RNF17Q9BXT8 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
RNF17Q9BXT8 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
RNF17Q9BXT8 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
RNF17Q9BXT8 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
RNF17Q9BXT8 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC27.34■■□□□ 1.97
RNF17Q9BXT8 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
RNF17Q9BXT8 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
RNF17Q9BXT8 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
RNF17Q9BXT8 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
RNF17Q9BXT8 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
RNF17Q9BXT8 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
RNF17Q9BXT8 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
RNF17Q9BXT8 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
RNF17Q9BXT8 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
RNF17Q9BXT8 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
RNF17Q9BXT8 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
RNF17Q9BXT8 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
RNF17Q9BXT8 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
RNF17Q9BXT8 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
RNF17Q9BXT8 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
RNF17Q9BXT8 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
RNF17Q9BXT8 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
RNF17Q9BXT8 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.33■■□□□ 1.97
RNF17Q9BXT8 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
RNF17Q9BXT8 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
RNF17Q9BXT8 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
RNF17Q9BXT8 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
RNF17Q9BXT8 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
RNF17Q9BXT8 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
RNF17Q9BXT8 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
RNF17Q9BXT8 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
RNF17Q9BXT8 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
RNF17Q9BXT8 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC27.32■■□□□ 1.96
RNF17Q9BXT8 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
RNF17Q9BXT8 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
RNF17Q9BXT8 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
RNF17Q9BXT8 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
RNF17Q9BXT8 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
RNF17Q9BXT8 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
RNF17Q9BXT8 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
RNF17Q9BXT8 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
RNF17Q9BXT8 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
RNF17Q9BXT8 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
RNF17Q9BXT8 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
RNF17Q9BXT8 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.31■■□□□ 1.96
RNF17Q9BXT8 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC27.31■■□□□ 1.96
RNF17Q9BXT8 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
RNF17Q9BXT8 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC27.31■■□□□ 1.96
RNF17Q9BXT8 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
RNF17Q9BXT8 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
RNF17Q9BXT8 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
RNF17Q9BXT8 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
RNF17Q9BXT8 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
RNF17Q9BXT8 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
RNF17Q9BXT8 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms