Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ16

SPOCK3, Testican-3, humanhuman

Predictions only

Length 436 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPOCK3Q9BQ16 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
SPOCK3Q9BQ16 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
SPOCK3Q9BQ16 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SPOCK3Q9BQ16 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SPOCK3Q9BQ16 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SPOCK3Q9BQ16 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SPOCK3Q9BQ16 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SPOCK3Q9BQ16 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SPOCK3Q9BQ16 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
SPOCK3Q9BQ16 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
SPOCK3Q9BQ16 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SPOCK3Q9BQ16 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SPOCK3Q9BQ16 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SPOCK3Q9BQ16 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SPOCK3Q9BQ16 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SPOCK3Q9BQ16 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SPOCK3Q9BQ16 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SPOCK3Q9BQ16 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SPOCK3Q9BQ16 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
SPOCK3Q9BQ16 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SPOCK3Q9BQ16 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SPOCK3Q9BQ16 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
SPOCK3Q9BQ16 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
SPOCK3Q9BQ16 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
SPOCK3Q9BQ16 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SPOCK3Q9BQ16 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SPOCK3Q9BQ16 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SPOCK3Q9BQ16 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SPOCK3Q9BQ16 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SPOCK3Q9BQ16 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SPOCK3Q9BQ16 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SPOCK3Q9BQ16 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SPOCK3Q9BQ16 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SPOCK3Q9BQ16 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SPOCK3Q9BQ16 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SPOCK3Q9BQ16 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SPOCK3Q9BQ16 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SPOCK3Q9BQ16 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
SPOCK3Q9BQ16 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SPOCK3Q9BQ16 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SPOCK3Q9BQ16 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
SPOCK3Q9BQ16 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
SPOCK3Q9BQ16 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SPOCK3Q9BQ16 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SPOCK3Q9BQ16 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SPOCK3Q9BQ16 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SPOCK3Q9BQ16 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
SPOCK3Q9BQ16 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SPOCK3Q9BQ16 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SPOCK3Q9BQ16 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SPOCK3Q9BQ16 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
SPOCK3Q9BQ16 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SPOCK3Q9BQ16 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SPOCK3Q9BQ16 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
SPOCK3Q9BQ16 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SPOCK3Q9BQ16 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SPOCK3Q9BQ16 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SPOCK3Q9BQ16 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SPOCK3Q9BQ16 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SPOCK3Q9BQ16 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SPOCK3Q9BQ16 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SPOCK3Q9BQ16 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SPOCK3Q9BQ16 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SPOCK3Q9BQ16 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SPOCK3Q9BQ16 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SPOCK3Q9BQ16 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SPOCK3Q9BQ16 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SPOCK3Q9BQ16 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SPOCK3Q9BQ16 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SPOCK3Q9BQ16 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
SPOCK3Q9BQ16 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SPOCK3Q9BQ16 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SPOCK3Q9BQ16 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SPOCK3Q9BQ16 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SPOCK3Q9BQ16 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SPOCK3Q9BQ16 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SPOCK3Q9BQ16 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SPOCK3Q9BQ16 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SPOCK3Q9BQ16 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SPOCK3Q9BQ16 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SPOCK3Q9BQ16 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SPOCK3Q9BQ16 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SPOCK3Q9BQ16 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SPOCK3Q9BQ16 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SPOCK3Q9BQ16 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SPOCK3Q9BQ16 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SPOCK3Q9BQ16 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SPOCK3Q9BQ16 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SPOCK3Q9BQ16 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SPOCK3Q9BQ16 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SPOCK3Q9BQ16 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SPOCK3Q9BQ16 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SPOCK3Q9BQ16 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SPOCK3Q9BQ16 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
SPOCK3Q9BQ16 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SPOCK3Q9BQ16 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SPOCK3Q9BQ16 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SPOCK3Q9BQ16 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SPOCK3Q9BQ16 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SPOCK3Q9BQ16 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32 ms