Protein–RNA interactions for Protein: Q96M43

NBPF4, Neuroblastoma breakpoint family member 4, humanhuman

Predictions only

Length 638 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NBPF4Q96M43 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
NBPF4Q96M43 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
NBPF4Q96M43 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
NBPF4Q96M43 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
NBPF4Q96M43 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
NBPF4Q96M43 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
NBPF4Q96M43 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
NBPF4Q96M43 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
NBPF4Q96M43 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
NBPF4Q96M43 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
NBPF4Q96M43 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
NBPF4Q96M43 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
NBPF4Q96M43 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
NBPF4Q96M43 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
NBPF4Q96M43 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
NBPF4Q96M43 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
NBPF4Q96M43 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
NBPF4Q96M43 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
NBPF4Q96M43 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
NBPF4Q96M43 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
NBPF4Q96M43 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
NBPF4Q96M43 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
NBPF4Q96M43 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
NBPF4Q96M43 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
NBPF4Q96M43 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
NBPF4Q96M43 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
NBPF4Q96M43 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
NBPF4Q96M43 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
NBPF4Q96M43 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
NBPF4Q96M43 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
NBPF4Q96M43 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
NBPF4Q96M43 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC24.63■■□□□ 1.53
NBPF4Q96M43 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
NBPF4Q96M43 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
NBPF4Q96M43 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
NBPF4Q96M43 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
NBPF4Q96M43 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
NBPF4Q96M43 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
NBPF4Q96M43 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
NBPF4Q96M43 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
NBPF4Q96M43 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
NBPF4Q96M43 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
NBPF4Q96M43 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
NBPF4Q96M43 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
NBPF4Q96M43 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
NBPF4Q96M43 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
NBPF4Q96M43 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
NBPF4Q96M43 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
NBPF4Q96M43 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
NBPF4Q96M43 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
NBPF4Q96M43 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
NBPF4Q96M43 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
NBPF4Q96M43 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
NBPF4Q96M43 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
NBPF4Q96M43 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
NBPF4Q96M43 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
NBPF4Q96M43 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
NBPF4Q96M43 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
NBPF4Q96M43 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
NBPF4Q96M43 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
NBPF4Q96M43 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
NBPF4Q96M43 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
NBPF4Q96M43 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
NBPF4Q96M43 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
NBPF4Q96M43 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
NBPF4Q96M43 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
NBPF4Q96M43 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
NBPF4Q96M43 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
NBPF4Q96M43 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
NBPF4Q96M43 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
NBPF4Q96M43 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
NBPF4Q96M43 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
NBPF4Q96M43 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
NBPF4Q96M43 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
NBPF4Q96M43 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
NBPF4Q96M43 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC24.6■■□□□ 1.53
NBPF4Q96M43 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
NBPF4Q96M43 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
NBPF4Q96M43 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
NBPF4Q96M43 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
NBPF4Q96M43 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
NBPF4Q96M43 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
NBPF4Q96M43 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
NBPF4Q96M43 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
NBPF4Q96M43 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
NBPF4Q96M43 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
NBPF4Q96M43 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
NBPF4Q96M43 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
NBPF4Q96M43 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
NBPF4Q96M43 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
NBPF4Q96M43 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
NBPF4Q96M43 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
NBPF4Q96M43 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
NBPF4Q96M43 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
NBPF4Q96M43 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
NBPF4Q96M43 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
NBPF4Q96M43 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
NBPF4Q96M43 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
NBPF4Q96M43 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
NBPF4Q96M43 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.5 ms