Protein–RNA interactions for Protein: Q8TBB5

KLHDC4, Kelch domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 520 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHDC4Q8TBB5 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
KLHDC4Q8TBB5 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
KLHDC4Q8TBB5 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
KLHDC4Q8TBB5 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
KLHDC4Q8TBB5 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
KLHDC4Q8TBB5 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
KLHDC4Q8TBB5 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
KLHDC4Q8TBB5 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
KLHDC4Q8TBB5 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
KLHDC4Q8TBB5 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
KLHDC4Q8TBB5 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
KLHDC4Q8TBB5 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
KLHDC4Q8TBB5 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
KLHDC4Q8TBB5 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
KLHDC4Q8TBB5 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
KLHDC4Q8TBB5 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
KLHDC4Q8TBB5 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
KLHDC4Q8TBB5 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
KLHDC4Q8TBB5 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
KLHDC4Q8TBB5 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
KLHDC4Q8TBB5 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
KLHDC4Q8TBB5 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
KLHDC4Q8TBB5 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
KLHDC4Q8TBB5 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
KLHDC4Q8TBB5 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
KLHDC4Q8TBB5 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
KLHDC4Q8TBB5 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
KLHDC4Q8TBB5 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
KLHDC4Q8TBB5 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
KLHDC4Q8TBB5 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
KLHDC4Q8TBB5 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
KLHDC4Q8TBB5 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
KLHDC4Q8TBB5 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
KLHDC4Q8TBB5 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
KLHDC4Q8TBB5 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
KLHDC4Q8TBB5 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
KLHDC4Q8TBB5 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
KLHDC4Q8TBB5 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
KLHDC4Q8TBB5 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
KLHDC4Q8TBB5 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
KLHDC4Q8TBB5 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
KLHDC4Q8TBB5 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
KLHDC4Q8TBB5 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
KLHDC4Q8TBB5 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
KLHDC4Q8TBB5 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
KLHDC4Q8TBB5 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
KLHDC4Q8TBB5 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
KLHDC4Q8TBB5 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
KLHDC4Q8TBB5 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
KLHDC4Q8TBB5 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
KLHDC4Q8TBB5 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC23.08■■□□□ 1.29
KLHDC4Q8TBB5 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
KLHDC4Q8TBB5 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
KLHDC4Q8TBB5 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
KLHDC4Q8TBB5 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
KLHDC4Q8TBB5 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
KLHDC4Q8TBB5 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
KLHDC4Q8TBB5 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
KLHDC4Q8TBB5 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC23.08■■□□□ 1.29
KLHDC4Q8TBB5 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
KLHDC4Q8TBB5 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
KLHDC4Q8TBB5 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
KLHDC4Q8TBB5 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
KLHDC4Q8TBB5 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
KLHDC4Q8TBB5 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
KLHDC4Q8TBB5 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
KLHDC4Q8TBB5 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
KLHDC4Q8TBB5 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
KLHDC4Q8TBB5 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC23.07■■□□□ 1.28
KLHDC4Q8TBB5 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
KLHDC4Q8TBB5 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
KLHDC4Q8TBB5 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
KLHDC4Q8TBB5 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
KLHDC4Q8TBB5 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
KLHDC4Q8TBB5 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
KLHDC4Q8TBB5 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
KLHDC4Q8TBB5 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
KLHDC4Q8TBB5 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
KLHDC4Q8TBB5 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
KLHDC4Q8TBB5 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
KLHDC4Q8TBB5 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
KLHDC4Q8TBB5 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
KLHDC4Q8TBB5 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
KLHDC4Q8TBB5 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
KLHDC4Q8TBB5 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC23.07■■□□□ 1.28
KLHDC4Q8TBB5 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
KLHDC4Q8TBB5 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
KLHDC4Q8TBB5 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
KLHDC4Q8TBB5 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
KLHDC4Q8TBB5 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
KLHDC4Q8TBB5 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
KLHDC4Q8TBB5 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
KLHDC4Q8TBB5 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
KLHDC4Q8TBB5 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
KLHDC4Q8TBB5 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
KLHDC4Q8TBB5 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
KLHDC4Q8TBB5 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
KLHDC4Q8TBB5 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
KLHDC4Q8TBB5 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
KLHDC4Q8TBB5 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 86.9 ms