Protein–RNA interactions for Protein: Q86XW9

NME9, Thioredoxin domain-containing protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME9Q86XW9 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
NME9Q86XW9 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
NME9Q86XW9 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
NME9Q86XW9 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
NME9Q86XW9 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
NME9Q86XW9 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
NME9Q86XW9 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
NME9Q86XW9 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
NME9Q86XW9 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
NME9Q86XW9 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
NME9Q86XW9 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
NME9Q86XW9 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
NME9Q86XW9 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
NME9Q86XW9 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
NME9Q86XW9 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
NME9Q86XW9 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
NME9Q86XW9 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
NME9Q86XW9 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
NME9Q86XW9 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
NME9Q86XW9 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
NME9Q86XW9 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
NME9Q86XW9 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
NME9Q86XW9 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
NME9Q86XW9 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
NME9Q86XW9 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
NME9Q86XW9 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
NME9Q86XW9 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
NME9Q86XW9 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
NME9Q86XW9 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
NME9Q86XW9 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
NME9Q86XW9 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
NME9Q86XW9 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
NME9Q86XW9 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
NME9Q86XW9 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
NME9Q86XW9 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
NME9Q86XW9 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
NME9Q86XW9 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
NME9Q86XW9 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
NME9Q86XW9 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
NME9Q86XW9 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
NME9Q86XW9 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
NME9Q86XW9 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
NME9Q86XW9 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
NME9Q86XW9 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
NME9Q86XW9 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
NME9Q86XW9 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
NME9Q86XW9 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
NME9Q86XW9 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
NME9Q86XW9 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
NME9Q86XW9 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
NME9Q86XW9 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
NME9Q86XW9 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
NME9Q86XW9 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
NME9Q86XW9 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
NME9Q86XW9 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
NME9Q86XW9 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
NME9Q86XW9 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
NME9Q86XW9 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
NME9Q86XW9 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
NME9Q86XW9 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
NME9Q86XW9 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
NME9Q86XW9 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
NME9Q86XW9 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
NME9Q86XW9 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
NME9Q86XW9 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
NME9Q86XW9 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
NME9Q86XW9 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
NME9Q86XW9 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC25.22■■□□□ 1.63
NME9Q86XW9 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
NME9Q86XW9 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
NME9Q86XW9 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
NME9Q86XW9 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
NME9Q86XW9 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
NME9Q86XW9 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
NME9Q86XW9 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
NME9Q86XW9 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
NME9Q86XW9 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
NME9Q86XW9 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
NME9Q86XW9 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
NME9Q86XW9 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
NME9Q86XW9 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
NME9Q86XW9 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
NME9Q86XW9 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
NME9Q86XW9 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
NME9Q86XW9 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
NME9Q86XW9 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
NME9Q86XW9 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
NME9Q86XW9 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
NME9Q86XW9 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
NME9Q86XW9 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
NME9Q86XW9 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
NME9Q86XW9 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
NME9Q86XW9 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
NME9Q86XW9 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
NME9Q86XW9 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
NME9Q86XW9 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
NME9Q86XW9 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
NME9Q86XW9 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
NME9Q86XW9 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
NME9Q86XW9 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.5 ms